47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5796 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  72.73 
 
 		 1594 aa  1430    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 976 aa  1989    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  39.37 
 
 		 1925 aa  510  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  37.39 
 
 		 1669 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  36.36 
 
 		 1606 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  35.82 
 
 		 1575 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  36.81 
 
 		 1669 aa  458  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  36.62 
 
 		 1642 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  34.5 
 
 		 1726 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  32.76 
 
 		 2077 aa  446  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  34 
 
 		 1649 aa  442  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  34.99 
 
 		 1700 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  34.98 
 
 		 1703 aa  435  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  34.99 
 
 		 1697 aa  432  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  34.98 
 
 		 1748 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  35.19 
 
 		 1701 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  35.14 
 
 		 1702 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  34.32 
 
 		 1693 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  34.78 
 
 		 1697 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  33.96 
 
 		 1706 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  32.97 
 
 		 2098 aa  420  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 1516 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  35.15 
 
 		 1956 aa  399  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  29.02 
 
 		 2274 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  31.47 
 
 		 2570 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  35.06 
 
 		 1417 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  28.29 
 
 		 1932 aa  356  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  27.57 
 
 		 1934 aa  346  1e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  30.69 
 
 		 2005 aa  335  3e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  31.92 
 
 		 1211 aa  331  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  25.44 
 
 		 2117 aa  313  6.999999999999999e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  30.23 
 
 		 1722 aa  298  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 1674 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  30.6 
 
 		 763 aa  202  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  28.28 
 
 		 761 aa  181  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  29.03 
 
 		 766 aa  167  8e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  26.75 
 
 		 526 aa  96.3  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  25.67 
 
 		 1328 aa  84.7  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  22.26 
 
 		 1379 aa  80.1  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  22.6 
 
 		 678 aa  75.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  31.54 
 
 		 903 aa  51.2  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  31.37 
 
 		 919 aa  49.3  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  30.3 
 
 		 1058 aa  48.9  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  31.62 
 
 		 669 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  22.31 
 
 		 468 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1198  SNF2-related protein  32.1 
 
 		 454 aa  45.8  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000524568  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  23.91 
 
 		 1154 aa  45.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>