More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5747 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4142  AMP-dependent synthetase and ligase  65.29 
 
 		 860 aa  952    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1889  AMP-dependent synthetase and ligase  53.85 
 
 		 860 aa  729    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0471823  normal  0.0591915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5341  AMP-dependent synthetase and ligase  50.35 
 
 		 915 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2855  AMP-dependent synthetase and ligase  89.99 
 
 		 829 aa  1476    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  51.08 
 
 		 889 aa  688    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.813754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1959  AMP-dependent synthetase and ligase  65.62 
 
 		 830 aa  1014    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1979  AMP-dependent synthetase and ligase  65.99 
 
 		 830 aa  1018    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.10033  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2121  AMP-dependent synthetase and ligase  48.17 
 
 		 868 aa  687    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5747  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 831 aa  1647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2025  AMP-dependent synthetase and ligase  65.99 
 
 		 830 aa  1018    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  64.78 
 
 		 862 aa  926    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0560008  normal  0.885424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2019  AMP-dependent synthetase and ligase  46.41 
 
 		 841 aa  589  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00459182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0772  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 887 aa  392  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0989084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2621  AMP-dependent synthetase and ligase  41.08 
 
 		 453 aa  300  8e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2512  AMP-dependent synthetase and ligase  39.82 
 
 		 460 aa  283  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.280527  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2843  AMP-dependent synthetase and ligase  42.9 
 
 		 459 aa  258  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0145799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3177  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 471 aa  231  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  43.28 
 
 		 534 aa  191  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  37.87 
 
 		 523 aa  187  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  33.99 
 
 		 490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 497 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 		 530 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 523 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  36.68 
 
 		 418 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 517 aa  169  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3314  amino acid adenylation domain-containing protein  25.95 
 
 		 923 aa  155  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 		 520 aa  154  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  37.64 
 
 		 526 aa  152  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 		 521 aa  150  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0267  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.31 
 
 		 492 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.250834 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3152  amino acid adenylation domain-containing protein  27.23 
 
 		 923 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2563  antibiotic biosynthesis protein, putative  25.33 
 
 		 923 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136066  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 538 aa  139  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 533 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 520 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 		 515 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 		 514 aa  136  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  28.38 
 
 		 529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 505 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 523 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 505 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.89 
 
 		 529 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 519 aa  128  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  34.06 
 
 		 522 aa  127  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.53 
 
 		 536 aa  125  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 510 aa  124  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 526 aa  124  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 523 aa  121  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4029  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 509 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 545 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 527 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 531 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.99 
 
 		 530 aa  118  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 		 553 aa  117  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  32.99 
 
 		 535 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  32.99 
 
 		 535 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  32.99 
 
 		 535 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  32.99 
 
 		 535 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  32.99 
 
 		 608 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.6 
 
 		 539 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0750  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  32.04 
 
 		 732 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.94 
 
 		 510 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  33.1 
 
 		 532 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  32.99 
 
 		 691 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2380  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 742 aa  114  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 529 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.35 
 
 		 514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 538 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3463  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  30.71 
 
 		 723 aa  111  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 585 aa  108  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4512  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  31.49 
 
 		 1139 aa  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132383  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  27.58 
 
 		 2138 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  32.65 
 
 		 570 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3617  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  30.21 
 
 		 725 aa  106  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0370  AMP-binding domain-containing protein  32.65 
 
 		 521 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2338  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 509 aa  106  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  32.65 
 
 		 521 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0119  AMP-binding domain-containing protein  32.65 
 
 		 521 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  32.65 
 
 		 521 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0916  AMP-binding protein  32.65 
 
 		 521 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0991636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3884  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 497 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.445629  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4115  AMP-dependent synthetase and ligase  32.32 
 
 		 517 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.5 
 
 		 512 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 		 556 aa  105  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00356403  decreased coverage  0.0000000268145 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1068  AMP-binding domain-containing protein  32.65 
 
 		 731 aa  104  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 		 511 aa  104  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0680  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 499 aa  104  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.03 
 
 		 510 aa  103  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.64 
 
 		 510 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0631  hypothetical protein  28.07 
 
 		 732 aa  103  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.64 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0647  hypothetical protein  27.79 
 
 		 724 aa  103  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.95 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 		 583 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0402  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  31.42 
 
 		 713 aa  102  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3277  bifunctional acyl-[acyl carrier protein] synthetase/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  27.95 
 
 		 719 aa  102  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>