251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3151 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3091  rarD protein  100 
 
 
312 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3151  transporter DMT superfamily protein  100 
 
 
312 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.224678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3111  transporter DMT superfamily protein  100 
 
 
312 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177004  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3638  transporter DMT superfamily protein  59.73 
 
 
296 aa  291  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2775  transporter DMT superfamily protein  60.43 
 
 
296 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826427  normal  0.361103 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6667  RarD protein, DMT superfamily transporter  52.36 
 
 
313 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.32 
 
 
302 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4403  RarD protein, DMT superfamily transporter  50.54 
 
 
304 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.34 
 
 
333 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.12 
 
 
301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  43.69 
 
 
310 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  40.2 
 
 
315 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0535  transporter DMT superfamily protein  45.96 
 
 
493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.595832  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07630  rarD protein  48.8 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  44.21 
 
 
297 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  42.24 
 
 
335 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3414  RarD protein, DMT superfamily transporter  46.67 
 
 
312 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  39.46 
 
 
313 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  39.46 
 
 
313 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  39.46 
 
 
313 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  39.46 
 
 
313 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  39.46 
 
 
313 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  39.46 
 
 
313 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  39.46 
 
 
313 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  40.13 
 
 
313 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  40.07 
 
 
307 aa  205  6e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  40.13 
 
 
313 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0466  transporter DMT superfamily protein  50 
 
 
316 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  39.46 
 
 
313 aa  203  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2792  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.58 
 
 
344 aa  202  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0394  transporter DMT superfamily protein  50.86 
 
 
321 aa  202  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1003  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.75 
 
 
319 aa  201  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2265  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.52 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5070  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.79 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21390  rarD protein  46.18 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000580416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7674  RarD protein, DMT superfamily transporter  45.54 
 
 
332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3395  RarD protein  42.52 
 
 
301 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96482  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.19 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  43.46 
 
 
308 aa  199  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0477  RarD protein, DMT superfamily transporter  43.54 
 
 
298 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.840744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0490  RarD protein, DMT superfamily transporter  42.91 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.156296  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  38.26 
 
 
305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  44 
 
 
311 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2699  RarD protein, DMT superfamily transporter  47.35 
 
 
302 aa  195  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  36.86 
 
 
304 aa  195  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  37.5 
 
 
305 aa  194  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4018  rarD protein  45.42 
 
 
316 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.61 
 
 
309 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  41.9 
 
 
294 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2679  RarD protein  44.92 
 
 
312 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  36.39 
 
 
296 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.39 
 
 
296 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  36.39 
 
 
296 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  36.39 
 
 
296 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  36.39 
 
 
296 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  39.25 
 
 
295 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0604  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.11 
 
 
307 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.452707  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  36.39 
 
 
296 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  40.14 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.61 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0778  RarD protein  34.59 
 
 
290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  35.99 
 
 
300 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  33.86 
 
 
318 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0570  hypothetical protein  44.75 
 
 
298 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  37.58 
 
 
298 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  36.12 
 
 
301 aa  189  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  39.37 
 
 
294 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  39.37 
 
 
294 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  36.18 
 
 
295 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2949  transporter DMT superfamily protein  44.37 
 
 
295 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  35.84 
 
 
295 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  38.83 
 
 
294 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  39.86 
 
 
295 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3544  RarD protein  41.67 
 
 
304 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  39.86 
 
 
295 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  35.81 
 
 
304 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  39.86 
 
 
295 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  39.59 
 
 
294 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0769  rarD protein  41.2 
 
 
303 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  36.15 
 
 
295 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  37.85 
 
 
294 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  34.14 
 
 
301 aa  186  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  36.07 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.19 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.98 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  38.1 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  33.88 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  33.88 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  38.19 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  38.19 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  37.41 
 
 
296 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  37.41 
 
 
296 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  39.93 
 
 
295 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  37.41 
 
 
296 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2425  RarD protein, DMT superfamily transporter  39.07 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  37.76 
 
 
294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0249  RarD protein, DMT superfamily transporter  40.27 
 
 
298 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046118  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0775  RarD protein, DMT superfamily transporter  44.91 
 
 
305 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  41.26 
 
 
293 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1859  RarD protein, DMT superfamily transporter  38.51 
 
 
310 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>