More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0887 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0870  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 453 aa  929    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0887  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 453 aa  929    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0876  glutamate--ammonia ligase  99.56 
 
 		 453 aa  927    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  43.74 
 
 		 458 aa  361  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  41.05 
 
 		 453 aa  335  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  42.53 
 
 		 451 aa  335  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  43.57 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  43.57 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  43.34 
 
 		 457 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  42.08 
 
 		 453 aa  320  5e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  41.24 
 
 		 455 aa  316  5e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  40.72 
 
 		 452 aa  315  7e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  40.53 
 
 		 461 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  40.89 
 
 		 451 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  40.89 
 
 		 451 aa  294  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  40.67 
 
 		 451 aa  292  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  34.77 
 
 		 444 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  35.99 
 
 		 463 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  34.76 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  31.83 
 
 		 444 aa  240  4e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  33.26 
 
 		 444 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  35.83 
 
 		 441 aa  239  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  34.16 
 
 		 442 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  33.03 
 
 		 436 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  32.42 
 
 		 444 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  31.52 
 
 		 446 aa  232  9e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  33.41 
 
 		 480 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  32.8 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  33.87 
 
 		 432 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  32.5 
 
 		 435 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  32.73 
 
 		 453 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  34.09 
 
 		 435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  31.82 
 
 		 435 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  31.38 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  35.06 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  34.53 
 
 		 435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  34.23 
 
 		 445 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  32.31 
 
 		 445 aa  219  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  33.03 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  33.56 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  31.82 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  33.77 
 
 		 448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  33.56 
 
 		 444 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  32.82 
 
 		 442 aa  216  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  33.1 
 
 		 432 aa  216  9e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.83 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  31.47 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  31.52 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  34.07 
 
 		 456 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  32.5 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  31.65 
 
 		 435 aa  214  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  32.24 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  32.75 
 
 		 442 aa  210  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  32.29 
 
 		 443 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  32.66 
 
 		 443 aa  209  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  34.16 
 
 		 451 aa  209  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  31.18 
 
 		 440 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  32.15 
 
 		 438 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  32.97 
 
 		 449 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  30.86 
 
 		 435 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  33.33 
 
 		 432 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 		 456 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  33.33 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  32.44 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  33.26 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  33.47 
 
 		 453 aa  204  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  33.48 
 
 		 436 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  33.48 
 
 		 436 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  33.48 
 
 		 436 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  31.94 
 
 		 444 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  30.96 
 
 		 444 aa  203  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  33.93 
 
 		 448 aa  202  7e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  32.96 
 
 		 442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  32.28 
 
 		 433 aa  199  6e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  31.98 
 
 		 444 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  31.17 
 
 		 442 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  31.59 
 
 		 459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  32.52 
 
 		 447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  33.03 
 
 		 435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  34.23 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  33.7 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  31.87 
 
 		 446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  32.43 
 
 		 443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  35.05 
 
 		 453 aa  196  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  35.58 
 
 		 456 aa  196  8.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  32.03 
 
 		 443 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  31.58 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  31.58 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  31.58 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  31.58 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  31.58 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  31.58 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  31.58 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  32.07 
 
 		 461 aa  194  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  34.8 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  31.58 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  30.73 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  32.32 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  30.97 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  31.15 
 
 		 450 aa  194  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>