82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4034 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4034  putative ferredoxin  100 
 
 
64 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  44.44 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  45.16 
 
 
69 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  49.21 
 
 
71 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  45.31 
 
 
69 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  41.94 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  43.55 
 
 
63 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  40.62 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  40.62 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  46.67 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  46.67 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  40.62 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  44.44 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  45 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  45 
 
 
63 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  45 
 
 
62 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  38.1 
 
 
62 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  38.1 
 
 
62 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  45 
 
 
62 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  40.62 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  33.33 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  36.07 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  40.62 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  36.07 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  34.92 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  39.68 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.71 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  36.07 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  34.92 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.48 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  37.7 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  31.67 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  36.51 
 
 
349 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  40.32 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3704  hypothetical protein  35 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623768  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.33 
 
 
62 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  35 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  35 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  34.92 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  34.92 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  37.7 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  29.51 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  31.67 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  36.51 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.67 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  30.65 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  35 
 
 
83 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  35.09 
 
 
59 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  34.43 
 
 
68 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  33.87 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  32.26 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  35.48 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 
60 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4202  ferredoxin  35.48 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0571776  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  40.62 
 
 
64 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  34.43 
 
 
67 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  33.87 
 
 
65 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  34.43 
 
 
67 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  34.43 
 
 
67 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  27.87 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3799  3Fe-4S ferredoxin  31.75 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131127  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  27.87 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  27.87 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  35.48 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  30.65 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  26.23 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  28.57 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  30.16 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  36.07 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  35.59 
 
 
505 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3954  protein of unknown function DUF1271  33.33 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  30.16 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  38.71 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  30.16 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  30.16 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  30.16 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.54 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.81 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>