More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0977 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
444 aa  912    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0277  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  60.69 
 
 
442 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00851915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2390  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  59.23 
 
 
446 aa  527  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.738622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2693  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.73 
 
 
442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0778  hypothetical protein  49.66 
 
 
445 aa  426  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.111344  unclonable  0.000000000000258626 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45 
 
 
443 aa  369  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3531  PmbA/TldD family protein  44.87 
 
 
445 aa  365  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.05 
 
 
437 aa  341  2e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.64 
 
 
474 aa  292  8e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.73 
 
 
458 aa  281  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.91 
 
 
458 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.21 
 
 
458 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.21 
 
 
458 aa  272  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.31 
 
 
454 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.57 
 
 
460 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.11 
 
 
460 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.05 
 
 
464 aa  203  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.89 
 
 
460 aa  202  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.24 
 
 
469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.92 
 
 
463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2720  microcin-processing peptidase 2  37.78 
 
 
460 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.77 
 
 
476 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_468  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.93 
 
 
461 aa  193  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.59 
 
 
475 aa  190  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0896  tldD protein  36.47 
 
 
460 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0420634  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.58 
 
 
497 aa  189  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.5 
 
 
462 aa  189  9e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0503  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.93 
 
 
458 aa  188  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0499899  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.14 
 
 
482 aa  186  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.9 
 
 
483 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  30.21 
 
 
467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1220  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.25 
 
 
481 aa  183  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.182154  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.75 
 
 
493 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  42.75 
 
 
497 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.75 
 
 
482 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.75 
 
 
482 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  42.35 
 
 
482 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.75 
 
 
482 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  42.75 
 
 
497 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  42.75 
 
 
497 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0527  TldD/PmbA family protein  32.29 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  34.62 
 
 
479 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6115  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.49 
 
 
495 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  42.91 
 
 
479 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.62 
 
 
479 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.75 
 
 
482 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  42.35 
 
 
482 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.91 
 
 
479 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  32.55 
 
 
481 aa  179  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.8 
 
 
482 aa  179  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0565  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.57 
 
 
490 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.153604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.13 
 
 
482 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2337  tldD protein  41.86 
 
 
498 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3334  tldD protein  41.86 
 
 
498 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3323  TldD/PmbA family protein  41.86 
 
 
498 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2218  TldD/PmbA family protein  41.86 
 
 
498 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.762939  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1296  tldD protein  41.86 
 
 
482 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.576694  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0488  tldD protein  41.86 
 
 
498 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3290  TldD/PmbA family protein  41.86 
 
 
498 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1111  tldD protein  41.86 
 
 
498 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0632  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.56 
 
 
512 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1055  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.41 
 
 
486 aa  177  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0657  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.56 
 
 
488 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0709  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.93 
 
 
488 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252063  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0255  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.93 
 
 
488 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0739  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.93 
 
 
488 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951584  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2645  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.56 
 
 
488 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  33.73 
 
 
480 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2509  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.56 
 
 
488 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.274022  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  34.06 
 
 
480 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0410  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.57 
 
 
482 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12720  Peptidase U62, modulator of DNA gyrase activity  42.29 
 
 
480 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.437341  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3827  microcin-processing peptidase 2  41.15 
 
 
488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.84 
 
 
482 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  41.25 
 
 
481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2006  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  32.22 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  41.57 
 
 
480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  41.57 
 
 
480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  33.89 
 
 
481 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0863  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.94 
 
 
480 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  32.81 
 
 
481 aa  173  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0726  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.33 
 
 
488 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.571248 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3559  protease TldD  40.94 
 
 
481 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3972  microcin-processing peptidase 2  40.74 
 
 
488 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3631  protease TldD  40.94 
 
 
481 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0205399 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3666  protease TldD  40.94 
 
 
481 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3560  protease TldD  40.94 
 
 
481 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  41.02 
 
 
481 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.09 
 
 
465 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3728  protease TldD  40.94 
 
 
481 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.376622  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2659  TldD protein  32.62 
 
 
486 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1139  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.64 
 
 
473 aa  171  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  41.73 
 
 
480 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  32.03 
 
 
483 aa  171  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01891  TldD  40.08 
 
 
481 aa  170  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  39.31 
 
 
481 aa  170  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.04 
 
 
462 aa  170  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0397  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.96 
 
 
460 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0503933 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.62 
 
 
462 aa  169  7e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.94 
 
 
479 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>