More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4327 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4327  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 		 498 aa  1003    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1794  propionyl-CoA carboxylase  76.51 
 
 		 498 aa  742    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1841  propionyl-CoA carboxylase  76.51 
 
 		 498 aa  742    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.151151  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2019  propionyl-CoA carboxylase  91.77 
 
 		 498 aa  911    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1775  propionyl-CoA carboxylase  76.51 
 
 		 498 aa  742    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  37.37 
 
 		 525 aa  297  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  39.63 
 
 		 514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  37.7 
 
 		 538 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  37.4 
 
 		 514 aa  277  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  33.67 
 
 		 518 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  34.68 
 
 		 531 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  34.87 
 
 		 514 aa  269  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  35.09 
 
 		 508 aa  269  8.999999999999999e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  34.7 
 
 		 516 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  32.75 
 
 		 514 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  34.86 
 
 		 512 aa  265  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2907  propionyl-CoA carboxylase  35.86 
 
 		 514 aa  264  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  35.4 
 
 		 513 aa  261  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2593  propionyl-CoA carboxylase  34.72 
 
 		 505 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  35.86 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  35.4 
 
 		 508 aa  261  3e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  34.06 
 
 		 516 aa  261  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  32.73 
 
 		 514 aa  260  4e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  35.24 
 
 		 517 aa  260  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2881  carboxyl transferase  35.1 
 
 		 514 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  35.87 
 
 		 513 aa  259  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  35.14 
 
 		 517 aa  259  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  36.61 
 
 		 523 aa  259  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  34.89 
 
 		 516 aa  259  6e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  35.09 
 
 		 516 aa  259  9e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  36.38 
 
 		 510 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  34.61 
 
 		 516 aa  259  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  36.53 
 
 		 529 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  34.83 
 
 		 517 aa  258  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  34.17 
 
 		 516 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  34.17 
 
 		 516 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  34 
 
 		 516 aa  257  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  35.29 
 
 		 520 aa  257  4e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  34.75 
 
 		 531 aa  257  4e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  33.93 
 
 		 522 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  35.86 
 
 		 515 aa  256  8e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  35.19 
 
 		 521 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  34.65 
 
 		 512 aa  255  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  36.58 
 
 		 515 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1854  propionyl-CoA carboxylase  34.86 
 
 		 505 aa  254  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1198  carboxyl transferase domain protein  36.12 
 
 		 548 aa  254  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000462076 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  34.02 
 
 		 516 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  32.74 
 
 		 518 aa  253  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0335  carboxyl transferase  32.63 
 
 		 514 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  33.73 
 
 		 528 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  33.67 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  32.25 
 
 		 513 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0317  carboxyl transferase  32.76 
 
 		 514 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  33.6 
 
 		 513 aa  252  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  35.56 
 
 		 513 aa  251  2e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0999  carboxyl transferase  33.87 
 
 		 527 aa  251  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0033  propionyl-CoA carboxylase  36.18 
 
 		 510 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  34.01 
 
 		 510 aa  250  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  37.27 
 
 		 510 aa  250  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  36.73 
 
 		 506 aa  249  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  32.13 
 
 		 508 aa  249  1e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13833  propionyl-CoA carboxylase beta subunit 4 accD4  36.93 
 
 		 522 aa  249  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0406479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5639  carboxyl transferase  36.13 
 
 		 516 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1170  carboxyl transferase  35.77 
 
 		 516 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  33.33 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  33.4 
 
 		 517 aa  248  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  33.06 
 
 		 519 aa  247  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  33.79 
 
 		 520 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  33.27 
 
 		 518 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  34.48 
 
 		 516 aa  246  6e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  32.52 
 
 		 520 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  32.74 
 
 		 517 aa  246  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  32.8 
 
 		 564 aa  246  9e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3945  Propionyl-CoA carboxylase  33.79 
 
 		 519 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  31.2 
 
 		 515 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  33.47 
 
 		 522 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1632  acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase component  35.5 
 
 		 540 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  33.73 
 
 		 516 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  33.99 
 
 		 516 aa  244  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3097  propionyl-CoA carboxylase  33.4 
 
 		 518 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.079837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  35.92 
 
 		 524 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0201  carboxyl transferase  31.71 
 
 		 521 aa  243  6e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0217258  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3787  Propionyl-CoA carboxylase  32.44 
 
 		 510 aa  243  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  34.01 
 
 		 542 aa  243  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  33.06 
 
 		 510 aa  243  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  31.1 
 
 		 513 aa  243  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  35.05 
 
 		 516 aa  243  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  33.68 
 
 		 513 aa  243  7e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  34.33 
 
 		 522 aa  242  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1906  carboxyl transferase  36.09 
 
 		 527 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  33.6 
 
 		 524 aa  241  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45886  predicted protein  34.43 
 
 		 581 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  33.33 
 
 		 510 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  34.25 
 
 		 534 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  34.65 
 
 		 550 aa  240  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  31.16 
 
 		 513 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  31.1 
 
 		 513 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  34.48 
 
 		 531 aa  239  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3989  carboxyl transferase  35.57 
 
 		 534 aa  239  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  31.36 
 
 		 513 aa  239  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>