More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2758 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  100 
 
 
532 aa  1047    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  76.88 
 
 
543 aa  787    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  68.17 
 
 
531 aa  686    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  76.88 
 
 
543 aa  787    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  76.88 
 
 
543 aa  787    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  83.55 
 
 
535 aa  879    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  56.43 
 
 
867 aa  561  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  47.92 
 
 
541 aa  463  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  49.15 
 
 
531 aa  461  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  50.56 
 
 
533 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.58 
 
 
548 aa  458  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  48.97 
 
 
541 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.3 
 
 
629 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  48.11 
 
 
534 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  46.49 
 
 
562 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  52.12 
 
 
534 aa  448  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  50 
 
 
543 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  47.94 
 
 
549 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  47.65 
 
 
619 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  47.25 
 
 
592 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  45.52 
 
 
611 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  47.46 
 
 
592 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  47.07 
 
 
627 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  48.03 
 
 
625 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0264  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 
527 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  47.41 
 
 
555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  48.01 
 
 
527 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  47.46 
 
 
592 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  43.71 
 
 
539 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.79 
 
 
632 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  44.64 
 
 
586 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  47.73 
 
 
531 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.87 
 
 
629 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  47.22 
 
 
555 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  49.81 
 
 
543 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  44.93 
 
 
530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.43 
 
 
643 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  48.02 
 
 
559 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  43.87 
 
 
571 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  44.4 
 
 
606 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  48.5 
 
 
555 aa  445  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  45.96 
 
 
609 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  46.32 
 
 
599 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  44.11 
 
 
566 aa  445  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  48.49 
 
 
533 aa  440  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  47.34 
 
 
527 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  46.96 
 
 
524 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  43.69 
 
 
571 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  47.33 
 
 
556 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  49.34 
 
 
537 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.3 
 
 
525 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  46.6 
 
 
536 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  47.45 
 
 
553 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.21 
 
 
626 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2209  ABC transporter related  48.67 
 
 
542 aa  438  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.326804  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  46.86 
 
 
640 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.83 
 
 
596 aa  438  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  48.78 
 
 
586 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  43.6 
 
 
588 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.86 
 
 
536 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 
571 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.52 
 
 
633 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1933  ABC transporter related  48.3 
 
 
542 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120655  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  47.36 
 
 
542 aa  435  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 
541 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  46.23 
 
 
536 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  45.73 
 
 
525 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  47.05 
 
 
537 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  43.75 
 
 
619 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  42.46 
 
 
547 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  46.46 
 
 
553 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  44.71 
 
 
611 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  46.34 
 
 
640 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  48.37 
 
 
585 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  45.03 
 
 
613 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.63 
 
 
632 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  44.95 
 
 
612 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  47.56 
 
 
544 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  46.5 
 
 
542 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 
633 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  41.87 
 
 
578 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  46.08 
 
 
555 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.48 
 
 
633 aa  430  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  46.13 
 
 
547 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  46.32 
 
 
633 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  46.79 
 
 
557 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  44.85 
 
 
611 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  43.88 
 
 
572 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.44 
 
 
619 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 
550 aa  430  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  46.2 
 
 
616 aa  432  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  45.61 
 
 
611 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  45.8 
 
 
593 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 
609 aa  431  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  48.21 
 
 
532 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.95 
 
 
617 aa  432  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  47.73 
 
 
542 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  45.39 
 
 
550 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  45.1 
 
 
576 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  45.49 
 
 
609 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>