76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1869 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  72.44 
 
 
509 aa  742    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
509 aa  1033    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  72.24 
 
 
509 aa  742    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  86.42 
 
 
509 aa  866    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  72.44 
 
 
509 aa  742    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.44 
 
 
797 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  45.51 
 
 
510 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  35.41 
 
 
517 aa  267  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  34.36 
 
 
506 aa  236  9e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  32.55 
 
 
492 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  32.55 
 
 
492 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  35.67 
 
 
474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  35.67 
 
 
474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  35.67 
 
 
474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  32.75 
 
 
492 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  33.47 
 
 
491 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  33.92 
 
 
491 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  34.52 
 
 
494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  34.62 
 
 
439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  36.34 
 
 
477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  30.54 
 
 
486 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  30.12 
 
 
498 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  30.53 
 
 
504 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  31.49 
 
 
515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  28.99 
 
 
503 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  28.04 
 
 
504 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  28.74 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  28.23 
 
 
494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.89 
 
 
382 aa  63.9  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  24.22 
 
 
389 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  25.07 
 
 
402 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  25.07 
 
 
402 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  25.07 
 
 
402 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2853  acetyl-CoA acetyltransferases  33.33 
 
 
441 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5103  lipid-transfer protein  25 
 
 
393 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22240  acetyl-CoA acetyltransferase  25.8 
 
 
392 aa  53.5  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1527  acetyl-CoA acetyltransferase  30.3 
 
 
398 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340504  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  27.56 
 
 
388 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1469  acetyl-CoA acetyltransferase  30.3 
 
 
398 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336544  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  27.75 
 
 
386 aa  50.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  31.39 
 
 
391 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  25.61 
 
 
387 aa  50.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  32.61 
 
 
384 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1544  acetyl-CoA acetyltransferase  31.06 
 
 
406 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  24.41 
 
 
388 aa  47.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3621  Acetyl-CoA C-acyltransferase  31.16 
 
 
395 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.905144  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  24.87 
 
 
395 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  33.58 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0618953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3456  acetyl-CoA acetyltransferase  23.54 
 
 
397 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614385  normal  0.375478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2215  acetyl-CoA acetyltransferase  23.53 
 
 
397 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4612  acetyl-CoA acetyltransferase  33.63 
 
 
392 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000000000297368  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4167  lipid-transfer protein  27.75 
 
 
396 aa  46.2  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3814  lipid-transfer protein  27.2 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0363497  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  23.84 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  26.15 
 
 
389 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  27.8 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11853  probable acetyl-CoA acetyltransferase  28.28 
 
 
392 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359273  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  23.28 
 
 
388 aa  45.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  29.2 
 
 
405 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1001  acetyl-CoA acetyltransferase  26.62 
 
 
400 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3523  acetyl-CoA acetyltransferase  23.79 
 
 
397 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  24.84 
 
 
401 aa  44.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2074  thiolase  28.78 
 
 
391 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000106789  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  24.69 
 
 
395 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  24.01 
 
 
388 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  25.13 
 
 
389 aa  44.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  28.15 
 
 
392 aa  43.9  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  25 
 
 
383 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  24.49 
 
 
383 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  26.18 
 
 
386 aa  43.5  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  24.22 
 
 
402 aa  43.5  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  25.07 
 
 
381 aa  43.5  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1841  acetyl-CoA acetyltransferase  23.27 
 
 
397 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219092  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  29.08 
 
 
399 aa  43.5  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0276  acetyl-CoA acetyltransferase  22.82 
 
 
393 aa  43.5  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00380599  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  29.93 
 
 
413 aa  43.1  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0375657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>