More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0901 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0901  response regulator receiver protein  100 
 
 		 230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5719  response regulator receiver protein  88.26 
 
 		 230 aa  353  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3653  response regulator receiver protein  88.26 
 
 		 230 aa  353  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5289  response regulator receiver protein  88.26 
 
 		 230 aa  353  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2842  response regulator receiver protein  58.37 
 
 		 292 aa  228  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1446  response regulator receiver protein  55.51 
 
 		 261 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1464  response regulator receiver protein  55.51 
 
 		 261 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4558  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 248 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  35.5 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  36.56 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 251 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 263 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  35.17 
 
 		 297 aa  95.5  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4873  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0727597  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 265 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 265 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 251 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.51 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4507  two component transcriptional regulator  47.92 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.75 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  31.72 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  29.44 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  28.7 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.39 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  32.13 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  27.51 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  34.65 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  27.51 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  28.38 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.69 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  35.48 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  42.86 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  43.75 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.52 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2466  two component transcriptional regulator  40.59 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.28267  hitchhiker  0.0000000000126243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  38.21 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  29.52 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  29.26 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.36 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  32.76 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  34.95 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.16 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  29.52 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2842  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.74 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  34.32 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.38 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  32.31 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.03 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  27.95 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  25.97 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.24 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.19 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  34.95 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.95 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.6 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  37.16 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.77 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.58 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.4 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.38 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  26.52 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  26.76 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  35.93 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  26.76 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  29.13 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  27.51 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  27.51 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  32.84 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  47.83 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  27.51 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  26.41 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.16 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  27.51 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.95 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.7 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2564  two component transcriptional regulator  46.74 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.6 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  36.02 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>