More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl533 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl533  multidrug ABC transporter  100 
 
 
635 aa  1301    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0537  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  54.03 
 
 
617 aa  644    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.68995  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl423  multidrug ABC transporter  44.44 
 
 
614 aa  451  1e-125  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.00524673  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl422  multidrug ABC transporter  41.36 
 
 
610 aa  405  1e-111  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl534  multidrug/protein/lipid ABC transporter ATP-binding component  38.98 
 
 
659 aa  403  1e-111  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.483013  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0538  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  39.97 
 
 
623 aa  398  1e-109  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.033802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  30.89 
 
 
579 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.76 
 
 
556 aa  261  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  28.99 
 
 
580 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.07 
 
 
587 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  30.74 
 
 
644 aa  243  9e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  30.65 
 
 
582 aa  241  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  33.4 
 
 
782 aa  240  5.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  32.25 
 
 
594 aa  239  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.36 
 
 
571 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  30.96 
 
 
650 aa  238  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  29.68 
 
 
572 aa  237  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.18 
 
 
571 aa  236  9e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.18 
 
 
571 aa  236  9e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.55 
 
 
571 aa  236  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.18 
 
 
571 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.18 
 
 
571 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.18 
 
 
571 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.18 
 
 
571 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.55 
 
 
571 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07730  multidrug resistance protein 1, putative  42.58 
 
 
1408 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  30.91 
 
 
584 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.18 
 
 
571 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  32.29 
 
 
613 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  31.65 
 
 
614 aa  234  3e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  31.38 
 
 
586 aa  234  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.88 
 
 
601 aa  234  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  35.19 
 
 
468 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  32.15 
 
 
1343 aa  234  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  31.65 
 
 
577 aa  233  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.88 
 
 
566 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  29.42 
 
 
660 aa  233  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  32.06 
 
 
566 aa  233  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.27 
 
 
572 aa  233  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  32.67 
 
 
586 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.89 
 
 
578 aa  232  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.89 
 
 
578 aa  232  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  30.27 
 
 
572 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  32.79 
 
 
594 aa  232  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.89 
 
 
586 aa  231  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  30.27 
 
 
572 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  33.07 
 
 
598 aa  231  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.74 
 
 
598 aa  230  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  31.78 
 
 
591 aa  230  7e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  29.28 
 
 
572 aa  230  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.14 
 
 
572 aa  229  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  31.14 
 
 
628 aa  229  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  30.63 
 
 
651 aa  229  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.95 
 
 
578 aa  229  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  29.32 
 
 
572 aa  229  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2936  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.74 
 
 
593 aa  229  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  31.54 
 
 
606 aa  229  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  33.6 
 
 
578 aa  229  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  31.08 
 
 
589 aa  229  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.24 
 
 
622 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  28.6 
 
 
576 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.74 
 
 
608 aa  229  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  31.73 
 
 
600 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  31 
 
 
600 aa  228  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  32.3 
 
 
597 aa  228  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  28.89 
 
 
639 aa  227  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.12 
 
 
626 aa  227  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.34 
 
 
618 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.5 
 
 
586 aa  227  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  30.26 
 
 
593 aa  227  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04517  ABC heavy metal ion transporter (Eurofung)  30.85 
 
 
920 aa  226  7e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  41.16 
 
 
613 aa  226  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.34 
 
 
618 aa  226  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  32.01 
 
 
581 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.58 
 
 
596 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  32.96 
 
 
611 aa  225  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  30.86 
 
 
648 aa  225  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  31.22 
 
 
582 aa  225  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  32.69 
 
 
608 aa  225  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  39.67 
 
 
614 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  34.16 
 
 
612 aa  224  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.25 
 
 
637 aa  224  4e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.34 
 
 
609 aa  224  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  31.45 
 
 
598 aa  224  4e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  29.34 
 
 
610 aa  224  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.14 
 
 
582 aa  224  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  31.68 
 
 
658 aa  224  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  29.66 
 
 
612 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0386  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.75 
 
 
593 aa  223  7e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.77 
 
 
637 aa  223  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  30.3 
 
 
627 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.91 
 
 
609 aa  222  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3055  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  29.58 
 
 
595 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0704257  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  32.61 
 
 
603 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  30.6 
 
 
620 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.91 
 
 
671 aa  222  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  29.18 
 
 
582 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  31.43 
 
 
634 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0671  ABC-type multidrug efflux pump, ATP-binding component  28.67 
 
 
607 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.123836  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  29.18 
 
 
582 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>