More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0588 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  94.74 
 
 		 551 aa  983    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 551 aa  1075    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  78.74 
 
 		 555 aa  816    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  58.67 
 
 		 539 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  56.02 
 
 		 531 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  57.65 
 
 		 526 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  36.99 
 
 		 733 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 		 1509 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  33.48 
 
 		 731 aa  258  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 		 958 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  40.53 
 
 		 635 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  36.76 
 
 		 684 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 		 1275 aa  253  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.24 
 
 		 610 aa  252  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 		 808 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  39.76 
 
 		 717 aa  250  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  39.53 
 
 		 710 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  38.88 
 
 		 602 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  40.21 
 
 		 670 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 		 652 aa  242  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  37.56 
 
 		 586 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 		 717 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 		 632 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 		 625 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 		 625 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.03 
 
 		 809 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 		 1486 aa  239  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  38.37 
 
 		 796 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  39.95 
 
 		 728 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  41.58 
 
 		 653 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 765 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 		 721 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  42.99 
 
 		 684 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.42 
 
 		 1561 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  35 
 
 		 617 aa  223  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 		 783 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 		 746 aa  222  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  43.45 
 
 		 775 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 1359 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 		 1759 aa  220  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 		 576 aa  220  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 		 709 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 		 709 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 		 625 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  36.03 
 
 		 1334 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  44.23 
 
 		 662 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  30.75 
 
 		 1152 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 723 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  30.75 
 
 		 1152 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  32.58 
 
 		 1644 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  32.58 
 
 		 1644 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 		 880 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  37.47 
 
 		 729 aa  196  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  33.25 
 
 		 794 aa  194  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  40.22 
 
 		 632 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 		 958 aa  191  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 983 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 		 832 aa  186  9e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  36.16 
 
 		 784 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  36.74 
 
 		 725 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  35.45 
 
 		 810 aa  182  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  36.46 
 
 		 732 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 		 1991 aa  179  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  41.54 
 
 		 725 aa  179  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 996 aa  177  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 		 658 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 		 1213 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 		 988 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 1198 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 		 1067 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 		 1191 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 857 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 1193 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 		 790 aa  171  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  31.91 
 
 		 1182 aa  169  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 		 556 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 		 742 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 		 742 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1694 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 		 1190 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 		 742 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 968 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 1187 aa  159  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.58 
 
 		 1173 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  29.38 
 
 		 1165 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  29.38 
 
 		 1165 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 		 1188 aa  153  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 974 aa  153  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 1297 aa  153  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  36.26 
 
 		 748 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 965 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 		 968 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 		 1177 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  31 
 
 		 1171 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  36.52 
 
 		 1084 aa  143  8e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 2046 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 734 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  33.11 
 
 		 1162 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0914  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 		 669 aa  124  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>