45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1562 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 159 aa  324  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  59.87 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  39.16 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  34.27 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  34.69 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  31.47 
 
 		 158 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  32.14 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  30 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  26.92 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  30 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  30.26 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  25.35 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  29.3 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  28.8 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  28.8 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  28.8 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  26.39 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  26.57 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  25.5 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  23.4 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  25.33 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  29.93 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  27.54 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  22.97 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  26.87 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  25.6 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  23.78 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  27.89 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  23.24 
 
 		 241 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  27.14 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10078  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.866988  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  31.76 
 
 		 192 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  24.24 
 
 		 175 aa  47.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  30.23 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 237 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  23.36 
 
 		 268 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  29.89 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  26.57 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  23.61 
 
 		 232 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  25.17 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  28.57 
 
 		 183 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  29.55 
 
 		 171 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  27.91 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>