47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0624 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  80.63 
 
 
761 aa  1314    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  81.55 
 
 
761 aa  1301    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  82.08 
 
 
761 aa  1316    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  69.17 
 
 
758 aa  1110    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  100 
 
 
761 aa  1553    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  42.69 
 
 
707 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  40.42 
 
 
710 aa  571  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  39.45 
 
 
722 aa  546  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  40.79 
 
 
611 aa  473  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  40.31 
 
 
612 aa  465  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  38.96 
 
 
612 aa  463  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  38.15 
 
 
612 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  39.81 
 
 
611 aa  457  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  39.59 
 
 
636 aa  440  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  38.09 
 
 
634 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  37.62 
 
 
648 aa  420  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  37.73 
 
 
637 aa  422  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  36.72 
 
 
641 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.19 
 
 
735 aa  232  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.18 
 
 
725 aa  206  9e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.28 
 
 
732 aa  206  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.92 
 
 
731 aa  181  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  29.7 
 
 
730 aa  180  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1825  chaperone protein DnaJ  35.29 
 
 
377 aa  51.2  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0942  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.5 
 
 
377 aa  50.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.122373  normal  0.06017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2486  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 
688 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.172439  normal  0.868366 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  37.35 
 
 
356 aa  47.8  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0260  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.2 
 
 
708 aa  47  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0777668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  37.35 
 
 
359 aa  47  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0392  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35 
 
 
693 aa  46.2  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0127  chaperone DnaJ  35.82 
 
 
378 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0078  chaperone protein DnaJ  32.93 
 
 
369 aa  46.2  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000211475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1161  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.39 
 
 
712 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000184021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  30 
 
 
121 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67817  predicted protein  33.75 
 
 
511 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.695962  normal  0.0282737 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  37.35 
 
 
356 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0078  chaperone protein DnaJ  32.93 
 
 
369 aa  46.2  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0264458  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2085  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  23 
 
 
525 aa  45.8  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0350737  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0797  heat shock protein DnaJ domain protein  30.86 
 
 
369 aa  45.4  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.95295 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  32.53 
 
 
382 aa  45.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2459  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.1 
 
 
710 aa  45.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00423347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  28.7 
 
 
124 aa  45.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3629  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30 
 
 
717 aa  44.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2053  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.47 
 
 
723 aa  44.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  35 
 
 
377 aa  44.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2561  DnaJ central domain protein  33.33 
 
 
519 aa  44.3  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00796281 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1450  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.33 
 
 
718 aa  44.3  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.103052  normal  0.272177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>