More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3304 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3304  acetolactate synthase catalytic subunit  100 
 
 
567 aa  1154    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2939  acetolactate synthase catalytic subunit  43.94 
 
 
570 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.653705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2924  acetolactate synthase catalytic subunit  36.94 
 
 
576 aa  352  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.304337  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0947  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.48 
 
 
543 aa  238  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0432  acetolactate synthase catalytic subunit  31.33 
 
 
538 aa  229  8e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15200  acetolactate synthase catalytic subunit  30.85 
 
 
586 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4075  acetolactate synthase catalytic subunit  29.47 
 
 
611 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.577425 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10808  thiamine pyrophosphate enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13620)  28.32 
 
 
562 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  28.03 
 
 
552 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  27.99 
 
 
554 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.41 
 
 
572 aa  143  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1470  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.05 
 
 
581 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  27.01 
 
 
541 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  27.51 
 
 
558 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.11 
 
 
563 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.29 
 
 
575 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.29 
 
 
575 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.29 
 
 
593 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0086  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.68 
 
 
574 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  26.21 
 
 
574 aa  137  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  26.21 
 
 
574 aa  137  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  27.32 
 
 
572 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.68 
 
 
559 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.21 
 
 
574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.61 
 
 
558 aa  135  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.21 
 
 
574 aa  134  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.21 
 
 
574 aa  134  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.74 
 
 
572 aa  134  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.21 
 
 
574 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  26.33 
 
 
574 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.67 
 
 
604 aa  133  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  27.23 
 
 
541 aa  133  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.5 
 
 
572 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  28.33 
 
 
543 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.96 
 
 
573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.15 
 
 
574 aa  131  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.91 
 
 
562 aa  131  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.91 
 
 
572 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.92 
 
 
559 aa  130  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.27 
 
 
572 aa  130  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.01 
 
 
584 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.084297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0128  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.01 
 
 
584 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.73 
 
 
572 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.14 
 
 
554 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.73 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.65 
 
 
584 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.57 
 
 
588 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.18 
 
 
573 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.6 
 
 
574 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0125  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.84 
 
 
584 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  27.53 
 
 
567 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.36 
 
 
572 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0458  glyoxylate carboligase  27.74 
 
 
594 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258476  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.19 
 
 
574 aa  129  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0127  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.84 
 
 
584 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.53134  hitchhiker  0.000772873 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2267  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.87 
 
 
549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  26.2 
 
 
541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.14 
 
 
572 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.97 
 
 
572 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.14 
 
 
572 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.65 
 
 
572 aa  128  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.05 
 
 
565 aa  128  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.39 
 
 
573 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  25.09 
 
 
573 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.16 
 
 
542 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  24.39 
 
 
582 aa  127  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.25 
 
 
573 aa  127  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.56 
 
 
572 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.09 
 
 
572 aa  127  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0294  putative pyruvate decarboxylase  25.26 
 
 
590 aa  127  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.01 
 
 
596 aa  126  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.92 
 
 
557 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  24.96 
 
 
586 aa  126  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  24.6 
 
 
566 aa  126  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.63 
 
 
557 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.17 
 
 
569 aa  126  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.36 
 
 
573 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  26.29 
 
 
551 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1526  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.6 
 
 
652 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29328 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.73 
 
 
573 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.76 
 
 
558 aa  124  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  23.78 
 
 
566 aa  124  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.87 
 
 
566 aa  124  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.83 
 
 
593 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3213  hypothetical protein  28.22 
 
 
523 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.13 
 
 
562 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.56 
 
 
563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.72 
 
 
588 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.51 
 
 
572 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  26.32 
 
 
623 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.65 
 
 
566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1157  glyoxylate carboligase  26.68 
 
 
594 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0609  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.92 
 
 
599 aa  121  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4308  glyoxylate carboligase  26.98 
 
 
594 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0403052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  27.1 
 
 
533 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3954  glyoxylate carboligase  26.35 
 
 
597 aa  121  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416682  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  22.9 
 
 
573 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.98 
 
 
563 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0609  acetolactate synthase, large subunit  25.77 
 
 
584 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0318526  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.24 
 
 
563 aa  120  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>