80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2940 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2940  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 366 aa  759    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1331  extracellular solute-binding protein family 1  32.96 
 
 		 367 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3006  extracellular solute-binding protein family 1  33.24 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2171  extracellular solute-binding protein family 1  30.68 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2512  extracellular solute-binding protein family 1  31.23 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2013  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2884  hypothetical protein  32.15 
 
 		 401 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33910  hypothetical protein  32.54 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116943  normal  0.200497 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21350  ABC-type Fe3+ transport system, substrate binding component  26.04 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4456  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00193533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1842  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0219325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  24.2 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1554  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202841  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2658  twin-arginine translocation pathway signal  24.3 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  21.62 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4453  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1463  extracellular solute-binding protein  20 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.512158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 326 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0544  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 322 aa  52.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 333 aa  53.1  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0120  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2934  hypothetical protein  22.53 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  22.63 
 
 		 343 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.14 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.14 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  26.14 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.14 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  26.14 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2937  putative periplasmic IRON-binding signal peptide protein  25.5 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.14 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 470 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  26.14 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 325 aa  50.4  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  24.53 
 
 		 364 aa  49.3  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.85 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2272  hypothetical protein  25.31 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.508192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  26 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  22.11 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5871  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0448  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.33 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1786  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.33 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.33 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34313  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.33 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3159  hypothetical protein  23.28 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0818  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.33 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2082  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.33 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0354  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.33 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  22.12 
 
 		 379 aa  44.3  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2948  ABC transporter substrate binding protein  25.34 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.17 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  22.22 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  21.48 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4354  putative ABC transport system, substrate-binding exported protein  20.36 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  25.5 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  24.09 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  22.58 
 
 		 343 aa  43.9  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 366 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 366 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  22.1 
 
 		 344 aa  43.5  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 322 aa  43.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3145  hypothetical protein  22.06 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 366 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 		 344 aa  43.1  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 		 344 aa  42.7  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 369 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>