126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3006 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1331  extracellular solute-binding protein family 1  96.46 
 
 		 367 aa  736    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3006  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 379 aa  780    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2013  extracellular solute-binding protein family 1  69.51 
 
 		 373 aa  544  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2171  extracellular solute-binding protein family 1  68.96 
 
 		 373 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2512  extracellular solute-binding protein family 1  68.68 
 
 		 373 aa  534  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33910  hypothetical protein  40.59 
 
 		 424 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116943  normal  0.200497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2884  hypothetical protein  41.59 
 
 		 401 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2940  twin-arginine translocation pathway signal  33.24 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5871  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  25.09 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  24.9 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  21.26 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 342 aa  62.8  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3231  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416701  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0970  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000273849  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  26.16 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.93 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  27.93 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.93 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  27.93 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.93 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.93 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1812  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.45 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.98446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.16 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  26.16 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  26.16 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.16 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.16 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1554  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.202841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.58 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1374  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.58 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  26.13 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4453  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 356 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2637  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 367 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.74 
 
 		 358 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3590  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.77 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1866  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.13 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.37 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4122  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0845667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4244  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611623  normal  0.0395193 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  26.16 
 
 		 358 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.45 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2897  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 343 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3273  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281784  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3199  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2124  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 350 aa  53.5  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4140  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 366 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0884015  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  23.11 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3666  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.818754 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1948  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113804  normal  0.383853 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1611  ABC transporter substrate-binding protein  25.81 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.791321  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1767  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  23.82 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal  0.0378604 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1735  ABC transporter substrate-binding protein  25.81 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2948  ABC transporter substrate binding protein  26.54 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0041  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 341 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  23.11 
 
 		 351 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  25 
 
 		 343 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 341 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 345 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1786  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.48 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1572  ABC transporter, substrate-binding protein  25.48 
 
 		 341 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1234  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  29.38 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1306  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 369 aa  49.7  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.701273  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1638  iron ABC transporter substrate-binding protein  25.42 
 
 		 266 aa  49.7  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.58 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3418  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5572  putative lipoprotein  28.09 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  22.31 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5382  putative lipoprotein  28.09 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.35 
 
 		 325 aa  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.843064  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2746  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.66 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.553799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2134  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.575498  normal  0.605089 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.35 
 
 		 338 aa  47  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3124  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 345 aa  47  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4201  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.6 
 
 		 371 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4695  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2152  putative periplasmic solute-binding protein  25.41 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.123138 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.27 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.12 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0950  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04877  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  24.58 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1027  hypothetical protein  26.09 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4046  putative periplasmic solute-binding protein  34.85 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0699034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  23.48 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>