47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2891 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  100 
 
 		 201 aa  397  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  34.62 
 
 		 678 aa  79.7  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  38 
 
 		 409 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  37.38 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  42.17 
 
 		 146 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  40.79 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  33.61 
 
 		 410 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  35 
 
 		 401 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  35 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  35 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  36.26 
 
 		 410 aa  65.1  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  39.05 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  33.91 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  35.87 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  39.29 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  35.87 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  35.24 
 
 		 417 aa  55.5  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  32.65 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  36.26 
 
 		 259 aa  51.6  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  34.34 
 
 		 171 aa  51.6  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  32.41 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  32.65 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  37.35 
 
 		 708 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  31.73 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  30.34 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  34.74 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  31.46 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  28.47 
 
 		 295 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  33.68 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  31.03 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  33.68 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  28.57 
 
 		 179 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  35.05 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  26.73 
 
 		 344 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  32.58 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  30 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  26.73 
 
 		 344 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  31.52 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  30.68 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  25.45 
 
 		 355 aa  42  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0990  cytochrome c, class I  32.14 
 
 		 159 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  26.73 
 
 		 346 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  30.68 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>