More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0801 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0801  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  100 
 
 
594 aa  1188    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.299799  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4783  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.91 
 
 
604 aa  491  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158368  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1526  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.48 
 
 
652 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4098  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  38.62 
 
 
595 aa  190  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0963685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.52 
 
 
568 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1424  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.62 
 
 
536 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0432  acetolactate synthase catalytic subunit  24.26 
 
 
538 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  23.39 
 
 
589 aa  108  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1896  benzoylformate decarboxylase  26.1 
 
 
529 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1679  benzoylformate decarboxylase  26.79 
 
 
518 aa  104  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10808  thiamine pyrophosphate enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13620)  30.77 
 
 
562 aa  101  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  23.96 
 
 
542 aa  100  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15200  acetolactate synthase catalytic subunit  29.62 
 
 
586 aa  99  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2583  benzoylformate decarboxylase  26.52 
 
 
535 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.380504  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2607  benzoylformate decarboxylase  26.34 
 
 
535 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955084  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  24.65 
 
 
539 aa  97.8  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1705  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.74 
 
 
540 aa  97.1  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0714  benzoylformate decarboxylase  26.67 
 
 
536 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.331157 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1023  benzoylformate decarboxylase  26.53 
 
 
529 aa  94.4  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3304  acetolactate synthase catalytic subunit  30.36 
 
 
567 aa  94  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.88 
 
 
561 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4075  acetolactate synthase catalytic subunit  28.29 
 
 
611 aa  90.9  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2758  thiamine pyrophosphate protein central region  28.46 
 
 
540 aa  89.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2939  acetolactate synthase catalytic subunit  25.57 
 
 
570 aa  88.6  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.653705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0308  benzoylformate decarboxylase  25.19 
 
 
528 aa  86.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0935953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.32 
 
 
559 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0743  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  22.69 
 
 
551 aa  85.1  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.341364 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  25.27 
 
 
575 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5047  benzoylformate decarboxylase  27.09 
 
 
533 aa  84.7  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133347  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0947  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  23.49 
 
 
543 aa  84  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  22.52 
 
 
566 aa  84  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  27.38 
 
 
540 aa  83.6  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.12 
 
 
499 aa  83.2  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.36 
 
 
554 aa  83.2  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  25.45 
 
 
575 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.87 
 
 
573 aa  82.4  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.12 
 
 
557 aa  82.4  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  22.11 
 
 
554 aa  82.8  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  25.95 
 
 
528 aa  81.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  23.99 
 
 
567 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2271  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  25.86 
 
 
547 aa  81.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  24.22 
 
 
543 aa  80.9  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  23.98 
 
 
550 aa  80.1  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2924  acetolactate synthase catalytic subunit  26.7 
 
 
576 aa  79.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.304337  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.38 
 
 
559 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  23.51 
 
 
622 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  24.08 
 
 
548 aa  78.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  24.54 
 
 
597 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2237  acetolactate synthase  21.2 
 
 
554 aa  76.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  25.97 
 
 
549 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2276  acetolactate synthase  21.2 
 
 
554 aa  76.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5914  benzoylformate decarboxylase  28.23 
 
 
535 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  21.1 
 
 
573 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  22.72 
 
 
574 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  21.25 
 
 
582 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  24.53 
 
 
591 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  25.84 
 
 
598 aa  75.1  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.4 
 
 
566 aa  74.7  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51596  predicted protein  22.26 
 
 
610 aa  74.3  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355056  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.22 
 
 
552 aa  74.3  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  24 
 
 
564 aa  74.7  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  23.09 
 
 
566 aa  74.3  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  24.75 
 
 
552 aa  73.6  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3951  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.61 
 
 
574 aa  73.6  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  23.99 
 
 
567 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.15 
 
 
570 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  24.36 
 
 
568 aa  73.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  23.99 
 
 
567 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  23.99 
 
 
567 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  23.99 
 
 
567 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  23.99 
 
 
567 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  23.99 
 
 
567 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.7 
 
 
569 aa  73.6  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  23.99 
 
 
567 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  24.23 
 
 
586 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  26.95 
 
 
568 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  24.19 
 
 
568 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  24.41 
 
 
574 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.95 
 
 
568 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  25.17 
 
 
539 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  25.17 
 
 
539 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  25.17 
 
 
539 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  25.17 
 
 
539 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1088  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  21.27 
 
 
533 aa  71.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.703546  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2539  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  24.9 
 
 
633 aa  72  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0377208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1900  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.95 
 
 
568 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  25.17 
 
 
539 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  25.17 
 
 
539 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  25.17 
 
 
539 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  24.67 
 
 
847 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  26.02 
 
 
559 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  24.01 
 
 
562 aa  71.2  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  23.62 
 
 
556 aa  70.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13507  acetolactate synthase large subunit ilvB2  25.21 
 
 
552 aa  70.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1938  thiamine pyrophosphate protein central region  25.7 
 
 
547 aa  70.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.684685  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2155  acetolactate synthase  21.48 
 
 
554 aa  70.9  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.22 
 
 
588 aa  70.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  25.33 
 
 
581 aa  70.5  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  22.42 
 
 
561 aa  70.1  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.97 
 
 
658 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>