More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0576 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0576  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57383  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  35.47 
 
 
826 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  34.36 
 
 
331 aa  85.5  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  27.74 
 
 
586 aa  85.1  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  30.99 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  29.76 
 
 
751 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  37.43 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  34.62 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  32.95 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  27.92 
 
 
517 aa  82.8  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  29.38 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  33.5 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  37.3 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  34.33 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2121  hypothetical protein  32.37 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  normal  0.0571528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
861 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  28.47 
 
 
325 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  34.87 
 
 
322 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  30.56 
 
 
314 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  26.67 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  28.88 
 
 
517 aa  78.2  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.5 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  35.12 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  33.17 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2381  hypothetical protein  36.05 
 
 
481 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00647578  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  35.59 
 
 
444 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  34.13 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  32.35 
 
 
1186 aa  76.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
442 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  36.16 
 
 
444 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  32.85 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  24.64 
 
 
742 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  28.03 
 
 
384 aa  75.5  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  25.27 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  36.05 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  30.4 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  33.79 
 
 
338 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  33.78 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  34.25 
 
 
468 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  30.42 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  31.03 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  32.14 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  31.31 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  32.18 
 
 
614 aa  73.6  0.000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  32.74 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  29.92 
 
 
352 aa  72  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  30.33 
 
 
351 aa  71.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  30.41 
 
 
605 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  32.57 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  35.26 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  28.71 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  27.91 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  30.83 
 
 
446 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  30.46 
 
 
829 aa  69.3  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  31.34 
 
 
348 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  36.23 
 
 
437 aa  68.9  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  32.88 
 
 
351 aa  68.6  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  30.31 
 
 
600 aa  68.6  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  27.78 
 
 
377 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  32.65 
 
 
294 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  32.66 
 
 
446 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  27 
 
 
309 aa  68.6  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  29.15 
 
 
624 aa  68.6  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  30.31 
 
 
549 aa  68.6  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  27.78 
 
 
421 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  31.43 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  27.7 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  38.46 
 
 
432 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  27.73 
 
 
390 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  31.34 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  30.85 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  28.12 
 
 
1911 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  34.81 
 
 
506 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1994  hypothetical protein  34.94 
 
 
304 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  34.3 
 
 
306 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  28.92 
 
 
409 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  29.24 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  32.84 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  30.97 
 
 
1190 aa  66.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  28.57 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  30.05 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  28.79 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  30.26 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  37.98 
 
 
432 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  37.98 
 
 
432 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  29.73 
 
 
510 aa  65.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  29.71 
 
 
447 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  31.94 
 
 
299 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  30.26 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  30.26 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  30.77 
 
 
291 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  30.88 
 
 
315 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  30.66 
 
 
325 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  35.39 
 
 
414 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  29.75 
 
 
318 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 
349 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>