45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2368 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2368  putative pilin, type IV  100 
 
 		 152 aa  298  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1056  hypothetical protein  37.4 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0657  hypothetical protein  30.46 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.385115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2111  putative pilin, type IV  45.45 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.601836 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2667  general secretion pathway protein H  34.09 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.668264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0013  general secretion pathway protein H  34.09 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.036848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0013  general secretion pathway protein H  34.09 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1885  general secretion pathway protein H  34.09 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.096237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3513  general secretion pathway protein H  34.09 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0225  general secretion pathway protein H  34.09 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2780  general secretion pathway protein H  34.09 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0012  general secretion pathway protein H  34.21 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  30.08 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.73 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0963  N-terminal methylation  32 
 
 		 170 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  31.11 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  35.38 
 
 		 229 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  39.71 
 
 		 179 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3941  general secretion pathway protein H  32 
 
 		 193 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  40.35 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  27.91 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4496  general secretion pathway protein H  42.31 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818073  normal  0.141626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  33.33 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0777  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  40.24 
 
 		 185 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  30.08 
 
 		 179 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  30 
 
 		 145 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1723  N-terminal methylation  35.94 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.370416  normal  0.0331224 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  39.13 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  39.13 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5690  general secretion pathway protein H  39.13 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138037  normal  0.133551 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  34.72 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  39.13 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  36.21 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.95 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2092  putative general secretion pathway protein H  36.99 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00990757  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3286  hypothetical protein  28.95 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  38.24 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  26.61 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  40.3 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  45.45 
 
 		 188 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2929  general secretion pathway protein H  26.44 
 
 		 188 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2925  comG operon protein 4  23.21 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  33.82 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  43.24 
 
 		 165 aa  40  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>