54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1455 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1455  V-type ATPase, D subunit  100 
 
 
223 aa  438  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206362  normal  0.242301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0963  V-type ATPase D subunit  76.68 
 
 
221 aa  333  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.611183  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2045  V-type ATPase, D subunit  57.35 
 
 
222 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1757  V-type ATPase, D subunit  42.93 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0067  V-type ATP synthase subunit D  36.89 
 
 
212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0369  V-type ATP synthase subunit D  37.14 
 
 
214 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2761  V-type ATPase, D subunit  34.85 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1204  V-type ATPase, D subunit  34.85 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00302283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2666  V-type ATPase, D subunit  34.85 
 
 
209 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0547  V-type ATP synthase subunit D  34.62 
 
 
211 aa  111  9e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1613  V-type ATP synthase subunit D  34.76 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0300  V-type ATP synthase subunit D  34.76 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0384  V-type ATP synthase subunit D  34.3 
 
 
207 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2562  V-type ATPase, D subunit  36.08 
 
 
215 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.930332 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1224  V-type ATP synthase subunit D  35.82 
 
 
220 aa  105  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.486034 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1100  V-type ATPase, D subunit  33.5 
 
 
206 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1286  V-type ATP synthase subunit D  33.17 
 
 
231 aa  102  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1607  V-type ATP synthase subunit D  35.87 
 
 
232 aa  102  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1245  V-type ATP synthase subunit D  33.99 
 
 
206 aa  102  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1137  V-type ATPase, D subunit  35.35 
 
 
216 aa  100  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00018509  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2343  V-type ATP synthase subunit D  33.67 
 
 
209 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.563261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1185  V-type ATP synthase subunit D  34.33 
 
 
209 aa  99  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722603  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1441  V-type ATP synthase subunit D  31.53 
 
 
225 aa  98.6  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0338173  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2675  V-type ATP synthase subunit D  32.16 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0283  V-type ATP synthase subunit D  31.66 
 
 
228 aa  91.7  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0289  V-type ATP synthase subunit D  35.18 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1768  V-type ATPase, D subunit  31.6 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2269  V-type ATP synthase subunit D  30.35 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3358  V-type ATPase, D subunit  31.16 
 
 
250 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1366  V-type ATPase, D subunit  30.65 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1607  V-type ATP synthase subunit D  29.95 
 
 
214 aa  85.9  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0230905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1888  V-type ATP synthase subunit D  29.95 
 
 
214 aa  85.9  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19380  V-type ATP synthase subunit D  28.5 
 
 
208 aa  85.5  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2362  V-type ATP synthase subunit D  29.06 
 
 
209 aa  84.7  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1684  V-type ATP synthase subunit D  26.87 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0860  V-type ATPase, D subunit  33.83 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3070  V-type ATP synthase subunit D  28.3 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0425  V-type ATPase, D subunit  30.2 
 
 
207 aa  79  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0524  V-type ATPase, D subunit  28.5 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0591  V-type ATPase, D subunit  29.27 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68566  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88668  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  28.72 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.877378  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_51058  predicted protein  29.41 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3440  V-type ATPase, D subunit  27.59 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0258  V-type ATPase, D subunit  26.74 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1248  V-type ATPase, D subunit  30.54 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1499  V-type ATPase, D subunit  32.32 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1919  V-type ATP synthase subunit D  25.12 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.487465  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1689  V-type ATPase, D subunit  25.37 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.366516 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2766  V-type ATPase, D subunit  26.96 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1632  V-type ATPase, D subunit  26.77 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00590  vacuolar ATP synthase subunit d, putative  28.96 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80851  vacuolar ATPase V1 domain subunit D  26.96 
 
 
264 aa  64.7  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1009  V-type ATPase, D subunit  25.13 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2081  H+-transporting two-sector ATPase, D subunit  25.12 
 
 
205 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.805056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>