293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0188 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 
384 aa  784    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  99.4 
 
 
336 aa  685    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0826  hypothetical protein  57.55 
 
 
445 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0133679 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7052  hypothetical protein  56.74 
 
 
392 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0830249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0163  hypothetical protein  55.21 
 
 
456 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3037  hypothetical protein  49.37 
 
 
433 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1613  hypothetical protein  49.12 
 
 
426 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144608  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7977  hypothetical protein  69.93 
 
 
497 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37687  normal  0.148037 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  31.17 
 
 
330 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1080  cytochrome d1 heme region  32.16 
 
 
331 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.952849  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  32.51 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.26 
 
 
328 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  32.31 
 
 
324 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2064  putative signal peptide protein  30.79 
 
 
339 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  31.63 
 
 
324 aa  146  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1437  hypothetical protein  30.64 
 
 
306 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2696  hypothetical protein  29.77 
 
 
330 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0538504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1749  hypothetical protein  29.77 
 
 
330 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472818  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1529  hypothetical protein  29.77 
 
 
330 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.435429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2775  hypothetical protein  29.77 
 
 
330 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3062  hypothetical protein  29.77 
 
 
330 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0002291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2258  hypothetical protein  29.77 
 
 
330 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2640  hypothetical protein  29.77 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388578  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1117  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.9 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.949748 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1839  hypothetical protein  29.43 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.172437  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5923  hypothetical protein  29.77 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2172  hypothetical protein  29.77 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2154  hypothetical protein  29.77 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.305615  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2064  hypothetical protein  28.9 
 
 
329 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5463  hypothetical protein  29.77 
 
 
329 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2191  hypothetical protein  28.9 
 
 
329 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1486  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.32 
 
 
337 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814871  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3159  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.97 
 
 
345 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2620  hypothetical protein  27.27 
 
 
339 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0272263  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1516  hypothetical protein  28.9 
 
 
339 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610036  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.14 
 
 
345 aa  138  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.24 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.45 
 
 
333 aa  133  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2785  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.89 
 
 
341 aa  123  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0917922  hitchhiker  0.00370167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1802  hypothetical protein  27.19 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000263268 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  28.37 
 
 
343 aa  116  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1627  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.27 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0205885  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2081  hypothetical protein  28.16 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 
776 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.78 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.52 
 
 
348 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.74 
 
 
312 aa  106  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.56 
 
 
366 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.43 
 
 
417 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.24 
 
 
353 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.57 
 
 
348 aa  97.8  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.46 
 
 
348 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.14 
 
 
347 aa  97.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.19 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.55 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.19 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.19 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.16 
 
 
362 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  25.52 
 
 
335 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.75 
 
 
377 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.25 
 
 
752 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  24.74 
 
 
1667 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.94 
 
 
689 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.49 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.51 
 
 
1170 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.68 
 
 
324 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.47 
 
 
345 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.47 
 
 
321 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.91 
 
 
324 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5386  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.3 
 
 
479 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.786395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  25.24 
 
 
479 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.08 
 
 
370 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.63 
 
 
329 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  26.27 
 
 
580 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.48 
 
 
334 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.48 
 
 
338 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.24 
 
 
329 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.53 
 
 
318 aa  86.3  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.98 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.1 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.43 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.33 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.97 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.93 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  26.03 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  24.48 
 
 
1094 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.19 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.16 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.39 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.06 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.71 
 
 
488 aa  82.8  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.66 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.35 
 
 
320 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.51 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.49 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  25.1 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2667  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.44 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896868  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.44 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581027  normal  0.0149347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>