More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1900 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1900  GMP synthase subunit B  100 
 
 
305 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0069  GMP synthase subunit B  79.34 
 
 
305 aa  502  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2139  GMP synthase subunit B  77.05 
 
 
305 aa  490  1e-137  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2527  GMP synthase subunit B  71.8 
 
 
305 aa  457  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0058  GMP synthase subunit B  68.2 
 
 
304 aa  436  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1178  GMP synthase subunit B  67.21 
 
 
305 aa  421  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0226  GMP synthase subunit B  65.46 
 
 
302 aa  412  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.612389  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1394  GMP synthase subunit B  64.71 
 
 
305 aa  393  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216363 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2593  GMP synthase subunit B  64.05 
 
 
305 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0761  GMP synthase, large subunit  64.05 
 
 
305 aa  378  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0426  GMP synthase subunit B  63.07 
 
 
305 aa  370  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628115  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2718  GMP synthase, large subunit  63.07 
 
 
305 aa  364  1e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0142  GMP synthase subunit B  54.92 
 
 
310 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  0.0356304 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1761  GMP synthase subunit B  54.6 
 
 
310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0702  GMP synthase subunit B  54.29 
 
 
310 aa  326  3e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28782  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0173  GMP synthase subunit B  53.65 
 
 
310 aa  326  3e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.768744  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0027  GMP synthase subunit B  53.65 
 
 
310 aa  323  3e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0586295  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0486  GMP synthase, large subunit  53.8 
 
 
312 aa  316  4e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  54.02 
 
 
511 aa  310  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  54.11 
 
 
512 aa  308  8e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  52.56 
 
 
501 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  52.56 
 
 
501 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  53.02 
 
 
512 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  53.02 
 
 
510 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  54.31 
 
 
517 aa  301  1e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  50.31 
 
 
537 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  48.91 
 
 
507 aa  300  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  50.31 
 
 
575 aa  299  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  49.2 
 
 
507 aa  298  6e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  51.09 
 
 
516 aa  298  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  51.11 
 
 
509 aa  298  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  50.78 
 
 
516 aa  297  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0959  GMP synthase, large subunit  51.75 
 
 
531 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  50.31 
 
 
528 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  51.11 
 
 
512 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  51.77 
 
 
511 aa  295  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  49.69 
 
 
528 aa  295  5e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  49.38 
 
 
528 aa  295  6e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  50.47 
 
 
510 aa  295  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  49.38 
 
 
528 aa  295  7e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  51.74 
 
 
516 aa  295  7e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  50.79 
 
 
512 aa  294  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  50.79 
 
 
515 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  50.79 
 
 
515 aa  294  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  48.15 
 
 
528 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  50.79 
 
 
512 aa  294  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  50.79 
 
 
512 aa  294  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  50.79 
 
 
512 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  50.79 
 
 
515 aa  294  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  50.79 
 
 
515 aa  293  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1430  GMP synthase  50.79 
 
 
524 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1494  GMP synthase  50.79 
 
 
524 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  50 
 
 
517 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  52.06 
 
 
513 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  51.89 
 
 
511 aa  293  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  51.07 
 
 
520 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  48.57 
 
 
523 aa  292  4e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.84 
 
 
510 aa  292  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  50.48 
 
 
510 aa  292  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  50.31 
 
 
516 aa  292  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  50.79 
 
 
512 aa  292  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  49.85 
 
 
526 aa  292  6e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  50.16 
 
 
512 aa  291  9e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  48.14 
 
 
528 aa  291  9e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  49.38 
 
 
528 aa  291  1e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0337  GMP synthase, large subunit  48.41 
 
 
510 aa  291  1e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  49.69 
 
 
548 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  50.62 
 
 
517 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  47.53 
 
 
575 aa  290  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  50.16 
 
 
509 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00361  GMP synthase  47.83 
 
 
528 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.819005  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  47.69 
 
 
542 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  51.43 
 
 
513 aa  289  4e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  49.52 
 
 
560 aa  289  4e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  50.16 
 
 
509 aa  289  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  47.8 
 
 
507 aa  289  5.0000000000000004e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  47.52 
 
 
528 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  50.78 
 
 
512 aa  288  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  49.54 
 
 
520 aa  288  6e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  50.16 
 
 
510 aa  288  6e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  50.63 
 
 
517 aa  288  8e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  49.52 
 
 
508 aa  287  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  48.89 
 
 
533 aa  287  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  48.87 
 
 
507 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  49.2 
 
 
513 aa  286  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  50.62 
 
 
512 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  47.98 
 
 
513 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  47.62 
 
 
520 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  49.68 
 
 
517 aa  285  5e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  47.94 
 
 
520 aa  285  7e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  48.92 
 
 
520 aa  285  7e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  48.89 
 
 
560 aa  285  9e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  48.14 
 
 
540 aa  285  9e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  48.73 
 
 
512 aa  284  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  49.06 
 
 
509 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  49.22 
 
 
507 aa  284  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  50.8 
 
 
534 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.54 
 
 
539 aa  283  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  47.47 
 
 
512 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  48.42 
 
 
511 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>