More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1699 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  100 
 
 		 371 aa  745    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  70.89 
 
 		 370 aa  565  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  72.13 
 
 		 371 aa  555  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  69.02 
 
 		 370 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  67.88 
 
 		 370 aa  518  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  56.6 
 
 		 364 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  53.66 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  54.35 
 
 		 363 aa  404  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  52.57 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  52.85 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  53.66 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  52.85 
 
 		 369 aa  381  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  47.55 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  47.58 
 
 		 369 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  46.5 
 
 		 369 aa  317  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  45.94 
 
 		 370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  44.44 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  45.66 
 
 		 370 aa  301  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  45.21 
 
 		 367 aa  294  1e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  44.79 
 
 		 368 aa  293  5e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  41.94 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  44.96 
 
 		 407 aa  286  5e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  43.4 
 
 		 378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.256152 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  42.02 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  42.18 
 
 		 410 aa  283  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  42.36 
 
 		 368 aa  278  7e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  44.66 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  42.44 
 
 		 373 aa  276  5e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  42.74 
 
 		 346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  41.51 
 
 		 374 aa  270  4e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  30.27 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  30.08 
 
 		 389 aa  146  5e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  28.88 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  27.1 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  28.65 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  25.65 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.741056 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  27.17 
 
 		 351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  26.63 
 
 		 387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  26.61 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  26.68 
 
 		 357 aa  110  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  25.75 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  35.34 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  33.83 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  33.83 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  36.84 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8476  GTP-binding protein YchF  25 
 
 		 362 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0805  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.21 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.82 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3062  GTP-binding protein YchF  35.51 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  40.91 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  35.71 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  42.17 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.43 
 
 		 416 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.84 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  38.04 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  37.21 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.95 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  26.29 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8269  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.23 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  35.71 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.45 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0946  GTP-binding protein YchF  25.68 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.63 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  36.36 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.48 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  40.23 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.32 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1390  GTP-binding protein YchF  29.6 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00313988  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  40.82 
 
 		 424 aa  59.3  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl660  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.24 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0442  GTP-binding protein YchF  34.29 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.637193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3612  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.75 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000132112  normal  0.101028 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  28.88 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  32.48 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.79 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.96 
 
 		 452 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  36.67 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.14 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2831  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  24.59 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0677  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.73 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  38.1 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0442  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.73 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0736  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.84 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2546  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  24.59 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000002151 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  35.23 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  37.96 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1166  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.91 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.219155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0708  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.02 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1002  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.45 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0699  GTPase ObgE  35.14 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.244108  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  31.91 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  40.95 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  36.8 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl522  GTPase ObgE  28.42 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3140  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.85 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.369877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2774  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.85 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.97205 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  36.8 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0101  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.51 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.720243  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3166  putative GTP-binding protein  34.91 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563466 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1047  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.63 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>