62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0468 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0468  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  226  7e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2431  putative signal peptide protein  37.72 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1583  hypothetical protein  31.82 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0253638  normal  0.163534 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1221  hypothetical protein  32.52 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1803  hypothetical protein  35.51 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.268314 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1031  hypothetical protein  33.9 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.454179 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0808  hypothetical protein  34.17 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.893436  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1135  hypothetical protein  35.19 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.401796 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0093  hypothetical protein  32.17 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0536  hypothetical protein  30.33 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0130  hypothetical protein  33.03 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.314669  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0468  hypothetical protein  33.94 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0179279  hitchhiker  0.0000000186223 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0466  hypothetical protein  33.93 
 
 
115 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1233  hypothetical protein  33.04 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0065  hypothetical protein  35.14 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0805  hypothetical protein  35.9 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6946  Domain of unknown function DUF1791  31.25 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1837  hypothetical protein  31.86 
 
 
150 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.412927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4380  hypothetical protein  35.77 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2602  hypothetical protein  33.33 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00587907  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1626  hypothetical protein  30.19 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1822  Domain of unknown function DUF1791  34.82 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.699958  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4969  hypothetical protein  35.54 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3773  hypothetical protein  35.65 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3680  hypothetical protein  29.82 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1398  domain of unknown function DUF1791  32.8 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3421  putative signal peptide protein  34.29 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4145  protein of unknown function DUF1791  36.36 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2282  hypothetical protein  35.14 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3253  putative signal peptide protein  33.91 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4871  hypothetical protein  32.99 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3127  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3455  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3257  putative signal peptide protein  35.24 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1016  hypothetical protein  32.08 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.041668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1908  hypothetical protein  31.15 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.512123 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1593  hypothetical protein  35.14 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0563903  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4264  hypothetical protein  31.71 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.901179  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0015  hypothetical protein  30.63 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000351673  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1669  hypothetical protein  35.14 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1053  hypothetical protein  30 
 
 
180 aa  51.6  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0564  hypothetical protein  30.25 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0140  hypothetical protein  32.46 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.422607  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0267  hypothetical protein  29.41 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000206306  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0120  protein of unknown function DUF1791  33.33 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0768427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6915  YchN-like domain-containing protein  32.23 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.521749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4164  protein of unknown function DUF1791  32.2 
 
 
153 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0139  hypothetical protein  31.2 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433672  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2301  Domain of unknown function DUF1791  35 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.583301  normal  0.0480111 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1835  hypothetical protein  35.04 
 
 
242 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292483 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3025  hypothetical protein  28.28 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0779  hypothetical protein  23.21 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.790907  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2158  hypothetical protein  25.38 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2894  hypothetical protein  27.56 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1472  hypothetical protein  32.2 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00198336  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2157  hypothetical protein  30.39 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0692  Domain of unknown function DUF1791  28.57 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0872755 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0691  Domain of unknown function DUF1791  26.79 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0623346 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0256  hypothetical protein  31.48 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0557189  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3670  hypothetical protein  29.06 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0180  hypothetical protein  32.08 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0563  hypothetical protein  28.95 
 
 
246 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>