More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2138 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  100 
 
 
383 aa  784    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  75.34 
 
 
374 aa  587  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  71.85 
 
 
375 aa  568  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1129  acetylornithine aminotransferase  65.51 
 
 
375 aa  528  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2526  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  67.51 
 
 
356 aa  502  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.645919  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  50.26 
 
 
403 aa  386  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  48.57 
 
 
390 aa  387  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  46.48 
 
 
399 aa  339  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  49.86 
 
 
380 aa  332  9e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  42.57 
 
 
396 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  44.02 
 
 
398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  45.01 
 
 
398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  43.51 
 
 
398 aa  315  7e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  41.93 
 
 
403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  43.23 
 
 
394 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.04 
 
 
395 aa  310  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 
396 aa  309  5e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  40.62 
 
 
395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.31 
 
 
396 aa  306  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  43.88 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  40.36 
 
 
395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  45.04 
 
 
394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  43.09 
 
 
392 aa  302  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  41.89 
 
 
390 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  41.65 
 
 
402 aa  302  8.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  41.82 
 
 
400 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  41.03 
 
 
396 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  42.13 
 
 
396 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  39.16 
 
 
395 aa  298  7e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.49 
 
 
399 aa  298  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  43.16 
 
 
391 aa  296  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  41.21 
 
 
394 aa  295  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.19 
 
 
410 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  42.93 
 
 
399 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  39.73 
 
 
388 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 
392 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.37 
 
 
436 aa  293  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  44.47 
 
 
408 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.65 
 
 
397 aa  292  5e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  46.22 
 
 
420 aa  292  5e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  40.57 
 
 
400 aa  292  6e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.74 
 
 
393 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4452  4-aminobutyrate aminotransferase  42.3 
 
 
441 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.36 
 
 
401 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.73 
 
 
394 aa  290  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  41.83 
 
 
444 aa  289  7e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.9 
 
 
416 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  39.85 
 
 
398 aa  286  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.47 
 
 
387 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.23 
 
 
400 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  39.15 
 
 
379 aa  283  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  41.44 
 
 
391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  43.8 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.55 
 
 
403 aa  283  5.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  38.48 
 
 
397 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  41.44 
 
 
400 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  42.4 
 
 
414 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25600  acetylornithine aminotransferase  42.04 
 
 
395 aa  280  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.99 
 
 
393 aa  281  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2054  acetylornithine aminotransferase  44.95 
 
 
403 aa  280  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  38.73 
 
 
397 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.76 
 
 
399 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  46.2 
 
 
395 aa  280  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  39.74 
 
 
395 aa  279  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  41.54 
 
 
431 aa  279  7e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144778  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  42.71 
 
 
386 aa  279  7e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.37 
 
 
399 aa  278  9e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  40.2 
 
 
399 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  42.06 
 
 
390 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  43.5 
 
 
386 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.78 
 
 
398 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.71 
 
 
417 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.22 
 
 
401 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  45.68 
 
 
423 aa  278  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  41.45 
 
 
385 aa  276  4e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  41.25 
 
 
431 aa  276  4e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  40.93 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  37.88 
 
 
418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  41.49 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  40.37 
 
 
400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.36 
 
 
412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.49 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  39.9 
 
 
391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  43.87 
 
 
390 aa  272  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.5 
 
 
393 aa  272  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.64 
 
 
402 aa  272  9e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  41.52 
 
 
425 aa  272  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  39.2 
 
 
426 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  39.41 
 
 
386 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.06 
 
 
393 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.67 
 
 
402 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  39.53 
 
 
428 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  39.3 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34500  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  41.01 
 
 
406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  38.79 
 
 
427 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  42.27 
 
 
402 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  42.27 
 
 
402 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  41.51 
 
 
432 aa  269  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  39.42 
 
 
398 aa  269  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  40.38 
 
 
386 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>