More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_B3748 on replicon NC_007349
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  100 
 
 
358 aa  734    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  65.63 
 
 
360 aa  487  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  40.19 
 
 
394 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  40.88 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  40.68 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  41.5 
 
 
396 aa  214  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  41.42 
 
 
386 aa  208  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 
421 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
386 aa  186  8e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
364 aa  120  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  32.71 
 
 
401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0309  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
396 aa  116  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 
360 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
398 aa  113  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
385 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
388 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 
393 aa  106  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 
389 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
394 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
388 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
417 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
388 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
388 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
355 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
398 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
396 aa  104  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
385 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  31.73 
 
 
390 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
388 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
388 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
409 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
388 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
411 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
391 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
439 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
398 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 
425 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 
348 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
388 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
388 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
382 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.52 
 
 
382 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
388 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
355 aa  99.4  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
380 aa  98.6  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
426 aa  99.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
415 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
377 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.97 
 
 
383 aa  97.8  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  24.37 
 
 
388 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
390 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
413 aa  97.4  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
395 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.73 
 
 
378 aa  96.7  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
382 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
385 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
375 aa  95.1  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
455 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
399 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  31.05 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  24.25 
 
 
446 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
414 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 
407 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
394 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
355 aa  93.6  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
351 aa  93.2  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 
396 aa  93.2  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  26.36 
 
 
416 aa  93.2  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
377 aa  92.8  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.77 
 
 
405 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25 
 
 
394 aa  92.8  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  28.02 
 
 
372 aa  92.8  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
374 aa  92.8  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.09 
 
 
381 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
421 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
383 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  21.68 
 
 
410 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.69 
 
 
381 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
536 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
382 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50490  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol (GPI) biosynthetic protein  27.64 
 
 
444 aa  91.3  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0309311  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
405 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
409 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
364 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>