More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2986 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 435 aa  885    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  73.54 
 
 		 414 aa  643    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  72.73 
 
 		 438 aa  644    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  73.54 
 
 		 414 aa  640    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  73.66 
 
 		 414 aa  638    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  70.93 
 
 		 415 aa  600  1e-170  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  64.63 
 
 		 413 aa  556  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  64.25 
 
 		 415 aa  535  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  62.07 
 
 		 427 aa  525  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  59.36 
 
 		 428 aa  511  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  59.32 
 
 		 412 aa  508  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  58.64 
 
 		 413 aa  495  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  58.84 
 
 		 412 aa  468  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  53.08 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  51.19 
 
 		 432 aa  438  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  51.87 
 
 		 433 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  51.07 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  49.41 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  52.81 
 
 		 694 aa  425  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  51.59 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1721  Phenylacetate--CoA ligase  51.6 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  47.66 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  48.06 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  45.43 
 
 		 432 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  46.47 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  48.06 
 
 		 434 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2338  Phenylacetate--CoA ligase  46.24 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  47.26 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  47.93 
 
 		 434 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  46.62 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  47.2 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  46.47 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  44.26 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  46.94 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  46.97 
 
 		 435 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  45.26 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  45.26 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  45.74 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  46.59 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  45.26 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  45.37 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  43.55 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  46.23 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  46.1 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  46.1 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  45.85 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  45.37 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  44.77 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  45.21 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  45.41 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  42.82 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  44.55 
 
 		 444 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  44.19 
 
 		 433 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  44.19 
 
 		 433 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  46.3 
 
 		 433 aa  362  8e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  43.35 
 
 		 432 aa  362  9e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  44.05 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  42.48 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  44.53 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  43.58 
 
 		 444 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  44.9 
 
 		 434 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  45.01 
 
 		 441 aa  359  4e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  44.9 
 
 		 433 aa  360  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  44.88 
 
 		 434 aa  359  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  42.82 
 
 		 434 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  44.31 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  42.51 
 
 		 434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  44.04 
 
 		 434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  44.99 
 
 		 434 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  44.01 
 
 		 434 aa  356  5e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  44.71 
 
 		 433 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  44.39 
 
 		 432 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  44.39 
 
 		 432 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  44.04 
 
 		 444 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  44.63 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  44.15 
 
 		 436 aa  353  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  43.46 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  42.93 
 
 		 433 aa  353  4e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  45.83 
 
 		 433 aa  353  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  42.04 
 
 		 431 aa  352  5.9999999999999994e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  43.2 
 
 		 433 aa  351  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  44.31 
 
 		 434 aa  351  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  42.89 
 
 		 439 aa  350  3e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  42.51 
 
 		 434 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  44.63 
 
 		 431 aa  350  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  43.77 
 
 		 437 aa  350  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  43.88 
 
 		 432 aa  349  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  44.42 
 
 		 433 aa  349  5e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  42.01 
 
 		 439 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  43.9 
 
 		 432 aa  349  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  39.67 
 
 		 432 aa  349  6e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  44.34 
 
 		 435 aa  348  9e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  42.23 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  41.78 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  43.9 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  43.9 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  44.15 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  43.9 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  42 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  43.34 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>