More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4308 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  100 
 
 
607 aa  1260    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5020  parB-like partition protein  30.87 
 
 
591 aa  220  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5238  parB-like partition protein  29.69 
 
 
554 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139889  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6241  ParB family protein  34.96 
 
 
574 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1596  parB-like partition protein  29.69 
 
 
554 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259007  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  28.88 
 
 
583 aa  207  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6529  parB-like partition protein  28.5 
 
 
555 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5589  parB-like partition protein  29.31 
 
 
559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3820  parB-like partition proteins  26.42 
 
 
564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.621795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1591  ParB family protein  34.91 
 
 
587 aa  193  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0914719  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5053  ParB family protein  26.93 
 
 
582 aa  176  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165275  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2542  ParB family protein  28.89 
 
 
587 aa  173  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.411196 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4412  parB-like partition proteins  27.58 
 
 
580 aa  171  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5341  ParB family protein  28.42 
 
 
569 aa  171  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0017765  normal  0.830623 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  38.98 
 
 
549 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  30.12 
 
 
668 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  35.23 
 
 
272 aa  110  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  39.18 
 
 
274 aa  108  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  31.53 
 
 
286 aa  104  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  32.29 
 
 
305 aa  103  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3193  parB-like partition proteins  27.89 
 
 
597 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101554  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  34.08 
 
 
310 aa  101  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  30.43 
 
 
281 aa  101  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  36.93 
 
 
304 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  35.08 
 
 
294 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  34.81 
 
 
289 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  34.36 
 
 
268 aa  100  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  28.78 
 
 
293 aa  98.6  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  35.57 
 
 
299 aa  97.4  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  31.49 
 
 
317 aa  97.4  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  29.94 
 
 
286 aa  97.4  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  29.94 
 
 
286 aa  97.4  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2139  parB-like partition protein  34.21 
 
 
367 aa  97.8  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  33.72 
 
 
305 aa  97.4  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  33.15 
 
 
314 aa  96.3  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  33.78 
 
 
301 aa  96.3  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  29.51 
 
 
285 aa  96.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  33.84 
 
 
269 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  29.44 
 
 
289 aa  96.3  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  31.02 
 
 
293 aa  96.3  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  31.02 
 
 
293 aa  96.3  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  33.15 
 
 
296 aa  95.9  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  30.22 
 
 
295 aa  95.9  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  33.33 
 
 
257 aa  95.5  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  31.21 
 
 
303 aa  95.1  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  31.03 
 
 
288 aa  95.5  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  28.73 
 
 
283 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  28.73 
 
 
283 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  30.85 
 
 
296 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  32.79 
 
 
304 aa  94.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  31.07 
 
 
297 aa  94.7  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  30.48 
 
 
605 aa  94.4  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  28.18 
 
 
283 aa  94  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  31.19 
 
 
362 aa  94  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  28.18 
 
 
256 aa  94  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  28.73 
 
 
283 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  30.41 
 
 
292 aa  93.6  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  32.42 
 
 
302 aa  93.6  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  32.4 
 
 
279 aa  93.6  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  33.53 
 
 
305 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  28.18 
 
 
283 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  31.13 
 
 
281 aa  93.2  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  28.18 
 
 
256 aa  93.6  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  28.18 
 
 
283 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  31.15 
 
 
290 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  28.18 
 
 
283 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  31.25 
 
 
294 aa  93.2  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  31.15 
 
 
290 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  31.15 
 
 
290 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  31.15 
 
 
290 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  31.15 
 
 
290 aa  92.8  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  31.15 
 
 
290 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  31.15 
 
 
290 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  31.15 
 
 
290 aa  92.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  29.94 
 
 
326 aa  92.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  32.56 
 
 
256 aa  92.4  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  30.17 
 
 
286 aa  92.8  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  31.15 
 
 
290 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  31.15 
 
 
290 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  27.62 
 
 
283 aa  92.8  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  32.22 
 
 
289 aa  92.4  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  29.77 
 
 
282 aa  92  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  31.49 
 
 
300 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  32.96 
 
 
290 aa  91.7  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  30.77 
 
 
291 aa  91.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  30.17 
 
 
294 aa  91.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  30.77 
 
 
293 aa  91.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  32.22 
 
 
315 aa  92  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  34.46 
 
 
299 aa  91.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  32.96 
 
 
288 aa  91.7  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  32.04 
 
 
303 aa  91.3  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  29.21 
 
 
297 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  33.33 
 
 
281 aa  91.3  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  31.07 
 
 
294 aa  91.3  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  33.53 
 
 
298 aa  91.3  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  30.6 
 
 
306 aa  91.3  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  30.6 
 
 
290 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  28.15 
 
 
292 aa  90.9  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  30.6 
 
 
290 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  28.15 
 
 
292 aa  90.5  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>