More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0309 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0309  ABC transporter related  100 
 
 
227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  45.87 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.66 
 
 
228 aa  167  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  42.66 
 
 
228 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  42.66 
 
 
228 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.66 
 
 
228 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  42.66 
 
 
228 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.66 
 
 
228 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.66 
 
 
228 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.66 
 
 
228 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.66 
 
 
228 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  41.26 
 
 
228 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 
224 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  42.79 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.72 
 
 
247 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.17 
 
 
225 aa  164  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.41 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  40.09 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.41 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.41 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  41.94 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  40.55 
 
 
225 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0969  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.96 
 
 
228 aa  162  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.41 
 
 
228 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.36 
 
 
225 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  40.38 
 
 
233 aa  161  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 
224 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.47 
 
 
252 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.47 
 
 
253 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.47 
 
 
252 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  40.83 
 
 
249 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.47 
 
 
253 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.47 
 
 
253 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  42.79 
 
 
244 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0686  ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 
229 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2670  ABC transporter, ATPase subunit  42.52 
 
 
236 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.983501  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  43.24 
 
 
217 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  44.13 
 
 
239 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  42.86 
 
 
227 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.01 
 
 
231 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.01 
 
 
252 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.96 
 
 
228 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.33 
 
 
242 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.33 
 
 
242 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  44.02 
 
 
217 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 
227 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 
224 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  42.13 
 
 
247 aa  158  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4686  ABC transporter related  43.24 
 
 
230 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  42.08 
 
 
235 aa  158  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.4 
 
 
247 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  40.74 
 
 
247 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  41.01 
 
 
235 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 
249 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  41.26 
 
 
227 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3651  ABC transporter component  42.72 
 
 
237 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  38.74 
 
 
247 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  39.91 
 
 
230 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2467  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
238 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  41.12 
 
 
246 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  38.94 
 
 
249 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  41.26 
 
 
228 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1943  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1217  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1450  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3362  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2309  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2288  ABC transporter, ATPase subunit  41.74 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.979484  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  43.18 
 
 
233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  39.35 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.86 
 
 
236 aa  155  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  41.26 
 
 
228 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  40.89 
 
 
243 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0412  ATPase  41.07 
 
 
249 aa  154  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.38 
 
 
249 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1913  ABC transporter related  41.74 
 
 
228 aa  154  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.598774  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.4 
 
 
249 aa  154  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2348  ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
238 aa  154  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.378115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 
240 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 
240 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 
227 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
234 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  40.74 
 
 
251 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.4 
 
 
249 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2040  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.71 
 
 
226 aa  153  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.4 
 
 
249 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0388  putative ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 
235 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  41.01 
 
 
227 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  41.4 
 
 
249 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5219  ABC transporter, ATPase subunit  42.73 
 
 
237 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  41.94 
 
 
228 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  39.53 
 
 
219 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
233 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  39.81 
 
 
250 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  40.18 
 
 
243 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  41.12 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.17 
 
 
258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.52 
 
 
228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  41.52 
 
 
228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>