154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0325 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0325  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 117 aa  229  6e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.914264  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl371  ribosome-binding factor A  50.45 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.61579e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  38.24 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2814  ribosome-binding factor A  33.03 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0180  ribosome-binding factor A  33.66 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03395  ribosome-binding factor A  30.56 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  35.56 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01304  ribosome-binding factor A  30.61 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.435847  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1008  ribosome-binding factor A  36.26 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211982  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0962  ribosome-binding factor A  32.43 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.394859  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0204  ribosome-binding factor A  33.65 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0175  ribosome-binding factor A  32.95 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.146816  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  33.72 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  34.88 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  34.88 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002610  ribosome-binding factor A  29.63 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  31.82 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  31.43 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0991  ribosome-binding factor A  32.29 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0599  ribosome-binding factor A  30.68 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.369509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  29.25 
 
 		 129 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1205  ribosome-binding factor A  32.98 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  29.46 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  29.46 
 
 		 123 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42810  ribosome-binding factor A  31.58 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  34.07 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1092  ribosome-binding factor A  34.07 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0591977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1031  ribosome-binding factor A  30.7 
 
 		 146 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571877  hitchhiker  0.000026303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  34.83 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0991  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00061052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  34.83 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  28.85 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  29.46 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  32.97 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  29.46 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1947  ribosome-binding factor A  29.25 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0382472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  31.4 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0399  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000842232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  27.88 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0923  ribosome-binding factor A  35.24 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.816784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2451  ribosome-binding factor A  32.61 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0315755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  28.44 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01291  ribosome-binding factor A  32.41 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.774457  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0368  ribosome-binding factor A  30.28 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159363  normal  0.435945 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  28.85 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09370  ribosome-binding factor A  27.59 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.394563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1809  ribosome-binding factor A  29.59 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.298116  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0815  ribosome-binding factor A  28.93 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0116201  normal  0.0354189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  24.77 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0370  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000258707  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  28.12 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08030  ribosome-binding factor A  25 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.536354  normal  0.36831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1290  ribosome-binding factor A  24.49 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0532539  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  30.19 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0630  ribosome-binding factor A  28.57 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0327  ribosome-binding factor A  34.45 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01261  ribosome-binding factor A  33.63 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0310075  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  32.08 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0384  ribosome-binding factor A  26.8 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3388  ribosome-binding factor A  34.18 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.990819  hitchhiker  0.00369045 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1383  ribosome-binding factor A  25.51 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01301  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.665223  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2833  ribosome-binding factor A  30.69 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  25.51 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.02264 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  25.83 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0746  ribosome-binding factor A  34.34 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321784  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3059  ribosome-binding factor A  32.91 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.491319  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0674  ribosome-binding factor A  26.67 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156226 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0115  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  30.69 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1314  ribosome-binding factor A  25.77 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  28.07 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  30.3 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  27.96 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3189  ribosome-binding factor A  26.8 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0454193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  29.09 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4642  ribosome-binding factor A  24.49 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1129  ribosome-binding factor A  30.39 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0360009  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3238  ribosome-binding factor A  30.39 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1226  ribosome-binding factor A  24.49 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.333897  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1329  ribosome-binding factor A  26.36 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3416  ribosome-binding factor A  30.39 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.523215  hitchhiker  0.00061048 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1118  ribosome-binding factor A  23.47 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  0.630529 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>