165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0674 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0674  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 119 aa  236  8e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000156226 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  34.43 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  37.04 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0991  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00061052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2815  ribosome-binding factor A  32.48 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473664  hitchhiker  0.00211169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  30.25 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  36.19 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0780  ribosome-binding factor A  35.4 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  37.8 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  35.24 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0998  ribosome-binding factor A  37.5 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00108919  normal  0.25507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2119  ribosome-binding factor A  30.25 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.328304  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  30.83 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10330  ribosome-binding factor A  37.62 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  32.38 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  34.29 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  32.26 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  35.16 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  33.64 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  34.17 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  33.7 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  32.48 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  35.19 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  29.66 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1164  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.338865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1232  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7740  ribosome-binding factor A  42.17 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  30.68 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  34.94 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  30.51 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1104  ribosome-binding factor A  29.09 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588249  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3560  ribosome-binding factor A  30.51 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466003  normal  0.834335 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  30.51 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  32.53 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  28.69 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0370  ribosome-binding factor A  30.51 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000258707  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1063  ribosome-binding factor A  39.29 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0406746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3223  ribosome-binding factor A  39.51 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  29.89 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0341  ribosome-binding factor A  29.66 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23440  ribosome-binding factor A  35.35 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.487539  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  31.78 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3590  ribosome-binding factor A  29.46 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0900161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  31.62 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11490  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871158  normal  0.911894 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1184  ribosome-binding factor A  30.7 
 
 		 189 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.352255 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  29.82 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_854  ribosome-binding factor A  27.12 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000358033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  29.46 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  29.17 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1744  ribosome-binding factor A  25.44 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  31.13 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  31.17 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07020  ribosome-binding factor A  36.56 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0301  ribosome-binding factor A  28.07 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  31.36 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  31.62 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0982  ribosome-binding factor A  24.58 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.385895  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2819  ribosome-binding factor A  26.73 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2688  ribosome-binding factor A  26.73 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  31.3 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3189  ribosome-binding factor A  29.03 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0454193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1310  ribosome-binding factor A  29.63 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.03706  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0399  ribosome-binding factor A  27.19 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000842232  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1248  ribosome-binding factor A  32.98 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0261774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  31.48 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1513  ribosome-binding factor A  32.26 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.121246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  29.75 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  29.41 
 
 		 123 aa  47.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1329  ribosome-binding factor A  29.41 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01271  ribosome-binding factor A  31.15 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1413  ribosome-binding factor A  29.82 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4166  ribosome-binding factor A  27.83 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000106795  hitchhiker  0.00000000804111 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2560  ribosome-binding factor A  32.22 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880777 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  25.66 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  30.77 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1247  ribosome-binding factor A  28.18 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0254008 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4876  ribosome-binding factor A  31 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.26776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3964  ribosome-binding factor A  29.41 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1143  ribosome-binding factor A  25.69 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1217  ribosome-binding factor A  28.18 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26151  ribosome-binding factor A  29.06 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>