281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1809 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1809  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 145 aa  292  9e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.298116  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09370  ribosome-binding factor A  72.88 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.394563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08030  ribosome-binding factor A  69.3 
 
 		 118 aa  164  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.536354  normal  0.36831 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0829  ribosome-binding factor A  60.19 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320879  hitchhiker  0.00000296727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2204  ribosome-binding factor A  35.45 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0068  ribosome-binding factor A  38.33 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00108757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3595  ribosome-binding factor A  35.77 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000837981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3994  ribosome-binding factor A  35.77 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.405974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3729  ribosome-binding factor A  35.77 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0092978  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3464  ribosome-binding factor A  35.83 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  30.65 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  41.35 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0809  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0586  ribosome-binding factor A  35.04 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3642  ribosome-binding factor A  38.53 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  37.86 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3474  ribosome-binding factor A  38.53 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03034  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.710808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0538  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3651  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02985  hypothetical protein  37.61 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.757266  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3604  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0531  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3359  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3463  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.287723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4488  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1329  ribosome-binding factor A  33.87 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0818  ribosome-binding factor A  35.85 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0100863 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1131  ribosome-binding factor A  31.01 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0305445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3345  ribosome-binding factor A  34.17 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.970615  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3580  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1008  ribosome-binding factor A  32.58 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0722  ribosome-binding factor A  29.84 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.041956 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3543  ribosome-binding factor A  37.61 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1693  ribosome-binding factor A  29.63 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0101873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  34.17 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  33.9 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0490  ribosome-binding factor A  32.14 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0822  ribosome-binding factor A  36.79 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0780  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000489115  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  26.45 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1028  ribosome-binding factor A  32.17 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0189385  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4489  ribosome-binding factor A  32.48 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0856583  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3604  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0265365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3474  ribosome-binding factor A  36.7 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1205  ribosome-binding factor A  30 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3964  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0901  hypothetical protein  39.58 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  36.46 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  32.35 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4711  ribosome-binding factor A  29.03 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165962  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4576  ribosome-binding factor A  29.03 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3752  ribosome-binding factor A  29.46 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104734  unclonable  0.0000134979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4711  ribosome-binding factor A  29.03 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31631 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0962  ribosome-binding factor A  30.63 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.394859  normal  0.0786715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23440  ribosome-binding factor A  36.27 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.487539  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4179  ribosome-binding factor A  31.06 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  31.07 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1027  ribosome-binding factor A  29.86 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1092  ribosome-binding factor A  29.86 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0591977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4038  ribosome-binding factor A  32.46 
 
 		 168 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.432163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2315  ribosome-binding factor A  31.9 
 
 		 163 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0767134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2416  ribosome-binding factor A  34.95 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1051  ribosome-binding factor A  35.09 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000570949  hitchhiker  0.000000154001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  32.76 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1477  ribosome-binding factor A  27.69 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1021  ribosome-binding factor A  27.69 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  33.04 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  31.78 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1501  ribosome-binding factor A  27.69 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236636  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3725  ribosome-binding factor A  41.9 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1184  ribosome-binding factor A  34.19 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.352255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  36.27 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3560  ribosome-binding factor A  38.64 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0991  ribosome-binding factor A  29.46 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  36.36 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1372  ribosome-binding factor A  34.29 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.589597  normal  0.116766 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  30.1 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1423  ribosome-binding factor A  27.07 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.02264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1383  ribosome-binding factor A  27.07 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1599  ribosome-binding factor A  31.78 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00660683  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0564  ribosome-binding factor A  31.78 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3607  ribosome-binding factor A  31.09 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.858095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  30.84 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1060  ribosome-binding factor A  28.71 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00435559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3059  ribosome-binding factor A  36.36 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.491319  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0992  ribosome-binding factor A  28.71 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1763  ribosome-binding factor A  28.71 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1916  ribosome-binding factor A  28.71 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  32.35 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0174  ribosome-binding factor A  28.71 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0246509  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2563  ribosome-binding factor A  28.71 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1506  ribosome-binding factor A  28.71 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1031  ribosome-binding factor A  29.17 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.571877  hitchhiker  0.000026303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1741  ribosome-binding factor A  28.71 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2027  ribosome-binding factor A  30.97 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373244  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3073  ribosome-binding factor A  31.25 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.729556  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1754  ribosome-binding factor A  28.71 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0297721 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  31.37 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>