More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2158 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  54.48 
 
 		 279 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  58.49 
 
 		 265 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  54.12 
 
 		 279 aa  309  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4046  AraC family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 289 aa  295  8e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  47.8 
 
 		 288 aa  289  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  48.78 
 
 		 286 aa  287  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4566  transcriptional regulator, AraC family  51.75 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1354  AraC family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.558119  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1644  transcriptional regulator, AraC family  49.3 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930139  normal  0.386203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 288 aa  279  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  46.69 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  46.1 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  45.76 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  46.1 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  45.76 
 
 		 288 aa  272  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 289 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  39.93 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0076  transcription activator, effector binding  38.33 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2489  transcription activator, effector binding  34.25 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  38.41 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1272  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.702716  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  38.62 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2590  transcription activator, effector binding  32.98 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  33.94 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02895  predicted transcriptional regulator  42.11 
 
 		 160 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02845  hypothetical protein  42.11 
 
 		 160 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.429305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0677  transcription activator effector binding protein  42.11 
 
 		 160 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3201  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  42.11 
 
 		 160 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0674  transcription activator effector binding  42.11 
 
 		 160 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.112574 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3457  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain protein  41.45 
 
 		 160 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3488  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  42.11 
 
 		 160 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3312  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain-containing protein  40.79 
 
 		 160 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.735437  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  31.49 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4332  transcription activator effector binding domain/DNA gyrase inhibitor domain protein  40.79 
 
 		 160 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  29.82 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  28.85 
 
 		 308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 287 aa  106  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  27.68 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  31.89 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.87 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  28.42 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  25.81 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 296 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  26.05 
 
 		 326 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  29.83 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  25.33 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  28.32 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  26.71 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  29.02 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  25.85 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 290 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 		 436 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  24.66 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  25.95 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0529  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  26.41 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>