265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2101 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  720    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  39.94 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  37.01 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  34 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  38.24 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  38.98 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  33.53 
 
 		 356 aa  215  8e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  31.64 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  31.64 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  31.64 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  31.64 
 
 		 352 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  33.24 
 
 		 352 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  35.03 
 
 		 354 aa  206  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  32.3 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  34.18 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  32.77 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  33.62 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  30.51 
 
 		 352 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  30.51 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  31.05 
 
 		 351 aa  199  9e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  30.51 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  30.51 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  31.53 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  32.94 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  31.75 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  31.83 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  29.86 
 
 		 352 aa  192  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  30.79 
 
 		 352 aa  192  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  35.21 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  34.55 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  30.51 
 
 		 353 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  34.38 
 
 		 358 aa  189  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  31.91 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  32.77 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  30.23 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  29.18 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  31.92 
 
 		 353 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  29.66 
 
 		 353 aa  186  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11680  permease YjgP/YjgQ family  33.05 
 
 		 353 aa  186  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  32.49 
 
 		 353 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  29.34 
 
 		 356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  32.49 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  29.63 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  29.86 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  30.06 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  29.11 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  29.39 
 
 		 355 aa  177  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  30.06 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  29.75 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  34.05 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0100  permease YjgP/YjgQ family protein  30.93 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  31.32 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0446  permease YjgP/YjgQ family protein  31.07 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  29.46 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  30.23 
 
 		 358 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0116  hypothetical protein  30.33 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0947899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  29.95 
 
 		 369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  28.98 
 
 		 356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  29.95 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  28.41 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0538  permease YjgP/YjgQ family protein  30.08 
 
 		 368 aa  162  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0426669  normal  0.993388 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  28.3 
 
 		 370 aa  162  7e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0403  permease YjgP/YjgQ  31.27 
 
 		 354 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0309466  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  28.16 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  29.3 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  26.7 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  27.68 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  27.68 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  27.68 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  30.86 
 
 		 362 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  28.69 
 
 		 360 aa  156  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  28.98 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  29.95 
 
 		 379 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  30.85 
 
 		 381 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  28.98 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  28.98 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  27.48 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  28.98 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  29.06 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  28.98 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  28.98 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  28.98 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  29.06 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  28.98 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  28.98 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  29.06 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  29.06 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  29.06 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  27.6 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1375  permease YjgP/YjgQ family protein  29.3 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  31.34 
 
 		 369 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  31.25 
 
 		 359 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  28.49 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0621  permease YjgP/YjgQ family protein  29.87 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185223  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  27.66 
 
 		 397 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  27.66 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1235  permease YjgP/YjgQ family protein  29.41 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.104582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  29.12 
 
 		 365 aa  150  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  28.2 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  28.2 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>