102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02588 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02588  Glycosyl transferase, family 2  100 
 
 
281 aa  583  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  29.88 
 
 
310 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
309 aa  92.8  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
305 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
313 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  25.62 
 
 
310 aa  85.9  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1063  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.991977 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
623 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
598 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  31.18 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  23.75 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
311 aa  75.5  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  23.01 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  22.54 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.83 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3588  glycosyl transferase family 2  24.08 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.690536  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00986  glycosyl transferase, family 2  27.15 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0498062  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 
324 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0441  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  23.04 
 
 
316 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 
331 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  21.72 
 
 
313 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  25.1 
 
 
322 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  23.12 
 
 
322 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  24.17 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  22.58 
 
 
338 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6856  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6733  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
333 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5124  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.91 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5523  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.91 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.91 
 
 
2401 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5280  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.91 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5677  group 2 family glycosyl transferase  22.91 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2677  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5926  succinoglycan biosynthesis protein  23.77 
 
 
310 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  21.58 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3846  glycosyl transferase family protein  22.59 
 
 
311 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  20.66 
 
 
642 aa  52.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  22.03 
 
 
525 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 
287 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  22.9 
 
 
331 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 
470 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  23.6 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 
421 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  22.65 
 
 
305 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  22.67 
 
 
1041 aa  49.7  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  22.08 
 
 
306 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  23.76 
 
 
317 aa  49.7  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
470 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  25.83 
 
 
338 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  24.53 
 
 
454 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0671  glycosyl transferase family protein  21.85 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 
748 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 
394 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0658  glycosyl transferase family protein  19.57 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
924 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 
326 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  22.7 
 
 
305 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 
345 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  23.69 
 
 
460 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  21.7 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4125  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 
426 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  24.11 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  21.7 
 
 
513 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0936  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.36 
 
 
323 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0930  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.36 
 
 
323 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  22.58 
 
 
470 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  22.87 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 
413 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0217  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
409 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3928  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
532 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4238  glycosyl transferase family protein  21.84 
 
 
330 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 
314 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  23.21 
 
 
326 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  22.49 
 
 
312 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 
333 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  22.83 
 
 
312 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  22 
 
 
333 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
753 aa  42.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  22 
 
 
333 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>