217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6829 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6829  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
332 aa  613  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7565  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  77.39 
 
 
337 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3195  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  65.12 
 
 
327 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2969  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  63.89 
 
 
327 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174646  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3151  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  64.42 
 
 
327 aa  345  6e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.669426  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0888  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  63.98 
 
 
326 aa  328  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160282 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  56.27 
 
 
337 aa  320  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314091  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1856  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.38 
 
 
338 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.287805  hitchhiker  0.00236278 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3177  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.27 
 
 
335 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1692  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  55.93 
 
 
345 aa  292  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1350  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  53.78 
 
 
340 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.271516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4108  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.35 
 
 
338 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1481  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.66 
 
 
343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4704  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.94 
 
 
343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2642  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.09 
 
 
333 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2094  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.51 
 
 
329 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234939  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0582  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.66 
 
 
331 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.576283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0897  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.32 
 
 
345 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0439  lipid-A-disaccharide synthase  45.97 
 
 
343 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422513  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.52 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0196  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.82 
 
 
341 aa  235  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0216  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.82 
 
 
341 aa  235  8e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.716971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0426  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.8 
 
 
346 aa  235  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  0.951399 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3047  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.82 
 
 
341 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1203  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.09 
 
 
339 aa  230  3e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.603805  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0650  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.09 
 
 
315 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0624  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50 
 
 
342 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0534  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.26 
 
 
347 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506816  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0490  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.1 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3121  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  53.18 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0031  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.47 
 
 
337 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249261 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0060  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.54 
 
 
332 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.27983 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1462  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.94 
 
 
332 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75413  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0113  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.07 
 
 
332 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.182493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4542  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.37 
 
 
335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0632  lipid-A-disaccharide synthase  44.1 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.11111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.24 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.93 
 
 
339 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.24 
 
 
339 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.62 
 
 
339 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.85 
 
 
327 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1508  lipid-A-disaccharide synthase  41.78 
 
 
329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.298775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.63 
 
 
338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.46 
 
 
331 aa  153  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.19 
 
 
338 aa  152  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.76 
 
 
341 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.36 
 
 
337 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.56 
 
 
335 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.05 
 
 
330 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  40.13 
 
 
333 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.66 
 
 
335 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.66 
 
 
335 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3570  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.86 
 
 
338 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  hitchhiker  0.00823889 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.92 
 
 
337 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.46 
 
 
331 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.84 
 
 
353 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.2 
 
 
366 aa  149  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.31 
 
 
331 aa  149  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.26 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.33 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.84 
 
 
335 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.66 
 
 
335 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.67 
 
 
771 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.155348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.05 
 
 
360 aa  146  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.7 
 
 
335 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.51 
 
 
372 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1433  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.06 
 
 
792 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2401  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.88 
 
 
349 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297195  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.22 
 
 
335 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.33 
 
 
349 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.91 
 
 
333 aa  142  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.28 
 
 
358 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  32.09 
 
 
375 aa  142  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3228  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.58 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2613  lipid-A-disaccharide synthase  42.95 
 
 
378 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2305  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.62 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0958647  normal  0.15261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1554  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.85 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.19 
 
 
348 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0848  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.25 
 
 
348 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.63 
 
 
326 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2152  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.72 
 
 
345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.101356  normal  0.391691 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3412  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.26 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.38 
 
 
343 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.29623  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2258  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.2 
 
 
353 aa  135  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  34.81 
 
 
330 aa  135  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3028  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.61 
 
 
361 aa  135  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.56 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.17 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0633  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0346  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.48 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2580  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.2 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117717  normal  0.111475 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.54 
 
 
337 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01857  tetraacyldisaccharide 4-kinase  35.56 
 
 
349 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223866  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.64 
 
 
430 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2794  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.9 
 
 
379 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.06 
 
 
346 aa  132  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2347  lipid-A-disaccharide synthase  39.34 
 
 
355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  33.44 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.06 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.59 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>