More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6815 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6815  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
428 aa  822    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.741432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  61.58 
 
 
468 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  56.44 
 
 
459 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  43.17 
 
 
437 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  41.88 
 
 
469 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  37.08 
 
 
903 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  40.85 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  37.27 
 
 
464 aa  116  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  41.2 
 
 
622 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.46 
 
 
858 aa  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 
735 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.58 
 
 
737 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  39.15 
 
 
483 aa  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9841  adenylate cyclase protein  34.93 
 
 
449 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  27.3 
 
 
864 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 
746 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  30.37 
 
 
614 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  33.51 
 
 
1207 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  30.12 
 
 
675 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.54 
 
 
648 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  31.6 
 
 
681 aa  106  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.48 
 
 
701 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  31.44 
 
 
859 aa  106  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  33.46 
 
 
645 aa  106  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.97 
 
 
757 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.46 
 
 
860 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  39.13 
 
 
488 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  33.8 
 
 
670 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  32.27 
 
 
702 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.33 
 
 
657 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  38.18 
 
 
488 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  37.77 
 
 
421 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  32.4 
 
 
358 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  33.17 
 
 
744 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  33.65 
 
 
729 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 
364 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  34.22 
 
 
717 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2096  adenylate/guanylate cyclase  38.52 
 
 
321 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0716073  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  29.72 
 
 
483 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.8 
 
 
656 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  35.59 
 
 
437 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  30.59 
 
 
483 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  35.59 
 
 
437 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  32.02 
 
 
638 aa  103  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  39.58 
 
 
618 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.47 
 
 
500 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40.1 
 
 
618 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0722  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.25 
 
 
613 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.02 
 
 
861 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  27.35 
 
 
284 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.58 
 
 
758 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3875  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  42.44 
 
 
499 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1200  histidine kinase HAMP region domain protein  40.11 
 
 
570 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.53 
 
 
672 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  31.19 
 
 
699 aa  100  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  37.36 
 
 
380 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  41.48 
 
 
549 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.58 
 
 
585 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.04 
 
 
656 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.77 
 
 
694 aa  99  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.06 
 
 
678 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  32.88 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.29 
 
 
696 aa  97.8  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  39.33 
 
 
536 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  39.33 
 
 
528 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  39.33 
 
 
528 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  34.32 
 
 
969 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  39.33 
 
 
528 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3816  putative adenylate/guanylate cyclase  39.41 
 
 
486 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.33 
 
 
723 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.78 
 
 
703 aa  97.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  36.11 
 
 
518 aa  97.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3830  adenylate/guanylate cyclase  39.41 
 
 
486 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3904  putative adenylate/guanylate cyclase  39.41 
 
 
486 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0256204  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6440  adenylate/guanylate cyclase  36.21 
 
 
463 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084335  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  27.54 
 
 
936 aa  96.7  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  31.75 
 
 
741 aa  96.7  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.48 
 
 
529 aa  96.3  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  29.95 
 
 
758 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  33.01 
 
 
513 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  32.09 
 
 
1020 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  32.06 
 
 
482 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  34.92 
 
 
650 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  29.73 
 
 
911 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 
1119 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  30.6 
 
 
712 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  40.23 
 
 
532 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.9 
 
 
723 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  32.11 
 
 
518 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  36.96 
 
 
577 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  41.51 
 
 
431 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.57 
 
 
658 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  39.01 
 
 
592 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  32.7 
 
 
487 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.48 
 
 
465 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  29.95 
 
 
758 aa  93.6  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
515 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  30.99 
 
 
607 aa  93.2  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  27.23 
 
 
701 aa  93.2  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  34.05 
 
 
636 aa  93.2  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>