46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5855 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  74.91 
 
 		 611 aa  744    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  100 
 
 		 580 aa  1068    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  39.12 
 
 		 634 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  40.29 
 
 		 610 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  38.74 
 
 		 632 aa  292  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  38.91 
 
 		 632 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  27.36 
 
 		 655 aa  132  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  28.52 
 
 		 656 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  27.54 
 
 		 643 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  27.26 
 
 		 642 aa  108  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  26.07 
 
 		 645 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  24.94 
 
 		 603 aa  94.7  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  26.31 
 
 		 648 aa  93.6  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  27.99 
 
 		 654 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  28.6 
 
 		 654 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  24.33 
 
 		 645 aa  91.3  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  25.1 
 
 		 655 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  26.69 
 
 		 649 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  23.94 
 
 		 649 aa  84.7  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  24.12 
 
 		 645 aa  84.7  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  25.53 
 
 		 608 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  24.13 
 
 		 651 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  24.26 
 
 		 630 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  29.49 
 
 		 649 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  30.59 
 
 		 655 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  23.33 
 
 		 630 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  21.4 
 
 		 626 aa  55.1  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  27.38 
 
 		 602 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  23.18 
 
 		 762 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  23.47 
 
 		 632 aa  52.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  25.45 
 
 		 761 aa  51.6  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  27.18 
 
 		 705 aa  50.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  23.7 
 
 		 677 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  24.7 
 
 		 1013 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  23.08 
 
 		 791 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  19.44 
 
 		 667 aa  46.6  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  26.44 
 
 		 611 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  25.25 
 
 		 617 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  25.25 
 
 		 617 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  25.25 
 
 		 617 aa  44.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  24.75 
 
 		 617 aa  44.3  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  25.45 
 
 		 712 aa  44.3  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  24.75 
 
 		 617 aa  44.3  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  24.75 
 
 		 617 aa  44.3  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  24.75 
 
 		 617 aa  44.3  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  26.16 
 
 		 682 aa  43.9  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>