245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1621 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1621  cytidine deaminase  100 
 
 		 135 aa  264  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0510  cytidine deaminase  88.15 
 
 		 142 aa  238  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3926  cytidine deaminase  82.35 
 
 		 120 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.705178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  60.8 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3149  cytidine deaminase  72.52 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  58.14 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3193  cytidine deaminase  75.38 
 
 		 137 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0570235  normal  0.552926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2967  cytidine deaminase  73.91 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0779026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1797  cytidine deaminase  61.9 
 
 		 179 aa  135  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  48.41 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  55.38 
 
 		 132 aa  133  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0262  cytidine deaminase  49.21 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4174  cytidine deaminase  49.17 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  46.92 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  48.33 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3655  cytidine deaminase  48.39 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  54.17 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  57.85 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  57.85 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  57.85 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0827  cytidine deaminase  52.76 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.577908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  45.38 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  41.46 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  41.46 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  53.17 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0716  cytidine deaminase  52.59 
 
 		 142 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  45.54 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  39.83 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  41.09 
 
 		 142 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  40.5 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  45.8 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  41.6 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  39.67 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  39.67 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  42.52 
 
 		 138 aa  105  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  41.88 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.91 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.736977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  39.68 
 
 		 130 aa  105  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  45.16 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0786  cytidine deaminase  49.61 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1572  cytidine deaminase  50.83 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  39.37 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  40.16 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  45.97 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  44.72 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  45.97 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  48 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  45.97 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  38.35 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  43.9 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  40 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1835  cytidine deaminase  45.22 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  39.06 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  40 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  38.58 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  37.8 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25720  cytidine deaminase  45.31 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  40.16 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2987  cytidine deaminase  52.5 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  45.04 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3537  cytidine deaminase  41.73 
 
 		 133 aa  99.4  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  42.74 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  40.31 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  40.98 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  42.64 
 
 		 138 aa  98.6  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  40.17 
 
 		 135 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  37.5 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21240  cytidine deaminase  47.5 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  40.98 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  44.53 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  39.17 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  36.57 
 
 		 134 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  38.1 
 
 		 132 aa  96.7  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  40.16 
 
 		 133 aa  96.7  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1356  cytidine deaminase  48.53 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl143  cytidine deaminase  33.83 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00772481  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3235  cytidine deaminase  49.14 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  46.96 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  45.31 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  46.88 
 
 		 181 aa  94.7  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  41.73 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  44.88 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  43.75 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2234  cytidine deaminase  43.86 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.561027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  37.8 
 
 		 137 aa  93.6  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1507  cytidine deaminase  46.43 
 
 		 134 aa  93.6  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.492073  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  42.52 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1214  cytidine deaminase  41.27 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>