More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1009 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1009  transposase  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  79.67 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  79.67 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  79.67 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  79.67 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  79.67 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  65.38 
 
 		 284 aa  254  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  79.25 
 
 		 265 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  71.18 
 
 		 195 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  71.18 
 
 		 195 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  63.69 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  63.33 
 
 		 283 aa  235  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  61.2 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  57.45 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  56.91 
 
 		 267 aa  228  8e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  56.91 
 
 		 267 aa  228  8e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  59.69 
 
 		 309 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0120  hypothetical protein  63.06 
 
 		 205 aa  199  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  58.97 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  58.97 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  58.97 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  58.97 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  54.39 
 
 		 276 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  53.11 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  50.84 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  50.84 
 
 		 278 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  56.94 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  56.94 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  56.94 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  51.32 
 
 		 250 aa  165  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  55.97 
 
 		 209 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  55.97 
 
 		 209 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  50.32 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  48.68 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  45 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0800  IstB ATP binding domain-containing protein  71.25 
 
 		 174 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0441  putative insertion element protein  53.4 
 
 		 111 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 358 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  36.26 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  36.26 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  36.26 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  36.26 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  41.11 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  41.11 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  59.46 
 
 		 174 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  36.76 
 
 		 285 aa  101  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  59.46 
 
 		 174 aa  101  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  36.76 
 
 		 285 aa  101  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  36.27 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  43.48 
 
 		 297 aa  99.8  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  40.12 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  38.8 
 
 		 263 aa  99.8  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  40.12 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  40.12 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  40.12 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  40.12 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  37.29 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3519  hypothetical protein  70.59 
 
 		 96 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.696579 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  37.16 
 
 		 305 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  37.16 
 
 		 305 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  36.02 
 
 		 272 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  36.02 
 
 		 272 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  36.02 
 
 		 272 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  36.02 
 
 		 272 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  36.02 
 
 		 272 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8384  hypothetical protein  55.17 
 
 		 134 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0960  transposase B  37.04 
 
 		 284 aa  95.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1724  transposase B  37.04 
 
 		 284 aa  95.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3249  transposase orfB  58.11 
 
 		 85 aa  95.1  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3886  transposase B  37.04 
 
 		 284 aa  95.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  37.04 
 
 		 284 aa  95.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  37.04 
 
 		 284 aa  95.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  37.04 
 
 		 284 aa  95.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  37.04 
 
 		 284 aa  95.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0092  transposase B  37.04 
 
 		 284 aa  95.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 279 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1112  integrase, catalytic region  43.75 
 
 		 148 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.329084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  40 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4236  integrase catalytic region  37.13 
 
 		 282 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179979  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  39.18 
 
 		 307 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0786  transposase B  36.51 
 
 		 284 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>