More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1569 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1569  winged helix family two component response transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  486  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000954897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.91 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  49.49 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.35 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  36.42 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  50.53 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  50.53 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  32 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  47.52 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  47.52 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  47.52 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  47.52 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  47.52 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  47.52 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  46.53 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  27.78 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  49.47 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  37.21 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  49.47 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  28.63 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  30.73 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.09 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.85 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  36.69 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  27.71 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  30.93 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  29.29 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  31.4 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1917  two component transcriptional regulator  35.22 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.332821 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  25.85 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  26.5 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  26.5 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  26.5 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2507  winged helix family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 233 aa  95.5  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.21 
 
 		 232 aa  95.5  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  27.47 
 
 		 235 aa  95.5  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  27.47 
 
 		 235 aa  95.1  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  27.47 
 
 		 235 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  29.66 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  29.66 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  29.66 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  29.66 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  27.47 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  29.66 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  29.66 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  26.36 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  28.63 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  29.66 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  30.72 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.56 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.54 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.5 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  29.51 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  26.07 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.96 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  27.59 
 
 		 229 aa  92.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  39.42 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.42 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0337  winged helix family two component response transcriptional regulator  41.51 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  44.33 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  46.51 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.94 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  29.14 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  27.55 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.62 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.35 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  35.8 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2570  response regulator receiver  45.65 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.16396 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  24.58 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.42 
 
 		 250 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  30.53 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.98 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37670  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.14 
 
 		 256 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0528352 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  42 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00974604  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  29.58 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  27.47 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4983  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  41.12 
 
 		 232 aa  89.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  28.81 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  27.47 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1845  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.983086  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  27.08 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.04 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.02 
 
 		 250 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 230 aa  88.6  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01810  transcriptional regulatory protein  34.38 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.53 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  32.75 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2025  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 261 aa  88.6  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>