More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1057 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 
333 aa  696    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  63.09 
 
 
334 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0332  transcriptional regulator  47.18 
 
 
386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1851  transcriptional regulator  48.55 
 
 
392 aa  299  4e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0435  transcriptional regulator  40.86 
 
 
427 aa  256  3e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1438  transcriptional regulator  47.25 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000544973  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  41.42 
 
 
374 aa  238  1e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0961  transcriptional regulator  37.57 
 
 
410 aa  237  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.62 
 
 
313 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.25 
 
 
488 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  38.51 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.41 
 
 
310 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  39.47 
 
 
304 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  36.96 
 
 
374 aa  205  8e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.54 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.79 
 
 
304 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.29 
 
 
303 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.29 
 
 
303 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.29 
 
 
303 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  39.61 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  36.3 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.1 
 
 
302 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  40.08 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.67 
 
 
318 aa  175  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  35.67 
 
 
318 aa  175  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  36.04 
 
 
302 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  33.55 
 
 
316 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  34.21 
 
 
408 aa  169  8e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0368  hypothetical protein  34.21 
 
 
435 aa  163  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.53 
 
 
338 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.77 
 
 
383 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  31.19 
 
 
333 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
333 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
335 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  31.19 
 
 
333 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  31.19 
 
 
333 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  32.27 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  31.85 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  31.48 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.07 
 
 
333 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  31.91 
 
 
333 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.82 
 
 
335 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  31.15 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  30.82 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.53 
 
 
374 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.1 
 
 
337 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.88 
 
 
329 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  30.49 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0489  transcription regulator  32.6 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  30.49 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  34.84 
 
 
377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  30.82 
 
 
337 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  30.82 
 
 
333 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  30.82 
 
 
338 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  34.02 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  34.02 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  34.02 
 
 
375 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  33.61 
 
 
377 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  34.44 
 
 
372 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  34.44 
 
 
374 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.45 
 
 
317 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.54 
 
 
319 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.1 
 
 
443 aa  122  7e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  32 
 
 
475 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.71 
 
 
322 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.09 
 
 
434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  31.95 
 
 
489 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.68 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.29 
 
 
512 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.19 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.85 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.75 
 
 
563 aa  117  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.77 
 
 
490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  30.11 
 
 
349 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.43 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.08 
 
 
453 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2595  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.14 
 
 
313 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.95 
 
 
495 aa  112  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  30.19 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0588  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 
432 aa  110  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.952975 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  29.81 
 
 
400 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.43 
 
 
414 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  29.81 
 
 
399 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4519  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.33 
 
 
505 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.11 
 
 
445 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.97 
 
 
362 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.83 
 
 
353 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.06 
 
 
401 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.26 
 
 
516 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.1 
 
 
436 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  29.63 
 
 
420 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  30 
 
 
584 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0015  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.77 
 
 
503 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348648  hitchhiker  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1857  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.65 
 
 
456 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.046941  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.49 
 
 
434 aa  105  9e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  37.42 
 
 
296 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>