More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0955 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0686  ABC transporter related  47.34 
 
 		 843 aa  778    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.409076 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0836  excinuclease ATPase subunit  46.14 
 
 		 862 aa  724    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19390  Excinuclease ATPase subunit  47.68 
 
 		 837 aa  792    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0955  ABC transporter related  100 
 
 		 837 aa  1728    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1665  excinuclease ATPase subunit  75.93 
 
 		 846 aa  1296    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1467  ABC transporter related  47.48 
 
 		 843 aa  778    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2119  ABC transporter related  50 
 
 		 836 aa  787    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  36.35 
 
 		 838 aa  552  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  36.47 
 
 		 838 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  35.81 
 
 		 838 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  35.67 
 
 		 877 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  36.32 
 
 		 853 aa  542  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  37.08 
 
 		 832 aa  539  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  36.7 
 
 		 827 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  36.05 
 
 		 850 aa  532  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  35.25 
 
 		 860 aa  529  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  33.85 
 
 		 897 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  36.27 
 
 		 844 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  34.4 
 
 		 950 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  34.53 
 
 		 843 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  35.77 
 
 		 838 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  34.8 
 
 		 834 aa  522  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  34.11 
 
 		 898 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  35.12 
 
 		 822 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1887  excinuclease ABC, A subunit  38.07 
 
 		 776 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.72737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  34.18 
 
 		 898 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  34.42 
 
 		 848 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  34.42 
 
 		 848 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  34.32 
 
 		 820 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  34.85 
 
 		 863 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  34.93 
 
 		 843 aa  511  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  34.88 
 
 		 861 aa  512  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  34.3 
 
 		 848 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5800  ABC transporter related  34.44 
 
 		 899 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.177592  normal  0.587186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3676  excinuclease ABC subunit A  35.75 
 
 		 880 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.090284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0102  excinuclease ABC, A subunit  35.04 
 
 		 894 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  33.29 
 
 		 823 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  34.3 
 
 		 885 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  35.36 
 
 		 851 aa  501  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  35.55 
 
 		 833 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  37.12 
 
 		 944 aa  492  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  37.52 
 
 		 947 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  38.95 
 
 		 960 aa  485  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07070  Excinuclease ABC subunit A  39.22 
 
 		 954 aa  479  1e-134  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.478607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  38.85 
 
 		 945 aa  482  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  37.37 
 
 		 947 aa  482  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0976  excinuclease ABC subunit A  38.55 
 
 		 931 aa  482  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.177637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1084  excinuclease ABC, A subunit  37.83 
 
 		 936 aa  477  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  37.68 
 
 		 963 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1787  ABC transporter related  34.83 
 
 		 845 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184754  normal  0.778498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2009  excinuclease ABC, A subunit  35 
 
 		 880 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2823  excinuclease ABC, A subunit  38.39 
 
 		 980 aa  478  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179729  normal  0.122251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  38.2 
 
 		 1008 aa  474  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  37.82 
 
 		 953 aa  474  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  36.39 
 
 		 939 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  38.62 
 
 		 952 aa  475  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  33.19 
 
 		 881 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  37.7 
 
 		 946 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0538  excinuclease ABC subunit A  39.6 
 
 		 970 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  37.28 
 
 		 954 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  36.1 
 
 		 939 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0252  excinuclease ABC (subunit A)  37.88 
 
 		 942 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00117135  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  36.59 
 
 		 957 aa  468  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1824  excinuclease ABC, A subunit  38.36 
 
 		 945 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00152877  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1322  excinuclease ABC, A subunit  37.75 
 
 		 934 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0124703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  37.25 
 
 		 946 aa  465  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4379  excinuclease ABC subunit A  37.88 
 
 		 1019 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612755  normal  0.0845587 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2585  excinuclease ABC subunit A  37.98 
 
 		 979 aa  463  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.771268  normal  0.888283 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  36.3 
 
 		 942 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1187  excinuclease ABC, A subunit  37.9 
 
 		 965 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  36.77 
 
 		 937 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3956  excinuclease ABC, A subunit  36.44 
 
 		 963 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000293672  hitchhiker  0.00020375 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  36.96 
 
 		 946 aa  462  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2191  excinuclease ABC, A subunit  36.77 
 
 		 946 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13060  Excinuclease ABC subunit A  36.77 
 
 		 968 aa  462  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  36.98 
 
 		 987 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  37.59 
 
 		 971 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  37.34 
 
 		 916 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0572  excinuclease ABC, A subunit  37.65 
 
 		 976 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.114911  normal  0.199492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3339  excinuclease ABC subunit A  36.98 
 
 		 987 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.535422  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  37.63 
 
 		 946 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  36.72 
 
 		 944 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0260  excinuclease ABC, A subunit  37.02 
 
 		 947 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0669187  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  36.27 
 
 		 958 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  36.27 
 
 		 958 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20120  Excinuclease ABC subunit A  39.05 
 
 		 982 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.578838  normal  0.503443 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1251  excinuclease ABC subunit A  39.09 
 
 		 971 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2851  excinuclease ABC, A subunit  38.98 
 
 		 960 aa  458  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.149004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1820  excinuclease ABC subunit A  36.65 
 
 		 954 aa  459  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.315317  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  36.92 
 
 		 942 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0694  excinuclease ABC subunit A  35.64 
 
 		 1004 aa  458  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.641362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0512  excinuclease ABC subunit A  36.35 
 
 		 944 aa  459  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1750  excinuclease ABC, A subunit  36.76 
 
 		 951 aa  458  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.173115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  36.42 
 
 		 958 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0157  excinuclease ABC, A subunit  36.62 
 
 		 954 aa  457  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.352383  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2524  excinuclease ABC subunit A  36.47 
 
 		 1019 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.247426  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1601  excinuclease ABC, A subunit  36.57 
 
 		 960 aa  457  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.409115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1256  excinuclease ABC, A subunit  37.75 
 
 		 966 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3065  excinuclease ABC, A subunit  36.34 
 
 		 956 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000246359  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0375  excinuclease ABC, A subunit  36.65 
 
 		 954 aa  459  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00180738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>