256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0091 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
416 aa  864    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  30.5 
 
 
411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0262  NADPH-dependent FMN reductase  31.71 
 
 
403 aa  186  5e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33413  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1749  flavoprotein  48.9 
 
 
184 aa  184  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000367939  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0413  hypothetical protein  50.57 
 
 
267 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000247794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1082  hypothetical protein  43.26 
 
 
200 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137626  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
202 aa  153  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1750  flavoprotein  40.22 
 
 
180 aa  138  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117667  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0090  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
203 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000795412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 
192 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  35.76 
 
 
186 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.81 
 
 
398 aa  97.4  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  36.21 
 
 
415 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  36.67 
 
 
406 aa  94  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  35.34 
 
 
421 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  34.85 
 
 
517 aa  92.4  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  32.58 
 
 
184 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.72 
 
 
540 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 
184 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  31.07 
 
 
184 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  30.91 
 
 
193 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  37.29 
 
 
407 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  32.12 
 
 
185 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  36.8 
 
 
395 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  31.52 
 
 
186 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  30.22 
 
 
411 aa  86.7  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
536 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  31.87 
 
 
187 aa  86.3  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  32.4 
 
 
189 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  30.71 
 
 
532 aa  84.3  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.66 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  39.17 
 
 
438 aa  83.2  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
220 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.89 
 
 
521 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  29.67 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  31.25 
 
 
517 aa  79  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
203 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0796  NADPH-dependent FMN reductase  31.18 
 
 
183 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  30.56 
 
 
185 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  31.67 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3581  NADPH-dependent FMN reductase  31.28 
 
 
204 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104879  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  32.24 
 
 
485 aa  79  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3083  NADPH-dependent FMN reductase  29.21 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  29.38 
 
 
184 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  27.17 
 
 
183 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  36.8 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  29.12 
 
 
188 aa  77  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  27.43 
 
 
410 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  31.45 
 
 
434 aa  77  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  29.12 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  29.12 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  29.12 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  29.12 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  29.12 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  29.12 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  29.12 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  33.87 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  34.19 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  37.19 
 
 
433 aa  76.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1668  azobenzene reductase  30 
 
 
178 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  35.38 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  28.81 
 
 
184 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
188 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 
190 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  25.68 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.48 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  28.96 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  33.06 
 
 
432 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5453  NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 
190 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.033171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  27.03 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  28.26 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  29.12 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  29.27 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  26.6 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2187  NADPH-dependent FMN reductase  29.14 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.171107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  30.22 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  26.49 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  27.12 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  28.25 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  28.57 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  28.57 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  28.57 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3976  NADPH-dependent FMN reductase  28.81 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  28.57 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0467  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 
189 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.450805  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2096  azobenzene reductase  33.79 
 
 
178 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284733  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
186 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  27.03 
 
 
184 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  32.2 
 
 
148 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  27.03 
 
 
184 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  27.03 
 
 
184 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  25.84 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2386  azoreductase  29.03 
 
 
178 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2056  azoreductase ( NAD(P)H oxidoreductase, quinone reductase )  29.57 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3197  NADPH-dependent FMN reductase  27.93 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3066  azoreductase  29.03 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2259  azoreductase  29.03 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  27.93 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>