46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3191 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  95.18 
 
 		 415 aa  771    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  850    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  42.13 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  41.15 
 
 		 411 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  42.79 
 
 		 407 aa  330  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  47.46 
 
 		 540 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  38.5 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  40.62 
 
 		 410 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  41.83 
 
 		 536 aa  292  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.23 
 
 		 521 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  39.42 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  35.96 
 
 		 485 aa  268  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.25 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  37.1 
 
 		 491 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  37.32 
 
 		 532 aa  258  2e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.69 
 
 		 342 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  33.42 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  33.72 
 
 		 433 aa  223  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  33.26 
 
 		 433 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  32.21 
 
 		 438 aa  216  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  37.98 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  35.93 
 
 		 321 aa  211  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  30.22 
 
 		 517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  26.77 
 
 		 434 aa  152  8e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.54 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  35.34 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  35.25 
 
 		 140 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  22.71 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  22.18 
 
 		 270 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1365  Domain of unknown function DUF1858  24.36 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  25.86 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 615 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0923  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 621 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 617 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0976  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.71 
 
 		 1079 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  28.83 
 
 		 459 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  25.96 
 
 		 311 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1871  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 842 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0359  sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  25 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0735  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 841 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 525 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2930  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  22.22 
 
 		 457 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1295  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  22.22 
 
 		 457 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62254e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>