38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0686 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  100 
 
 		 517 aa  1064    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  35.65 
 
 		 491 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  34.36 
 
 		 536 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 521 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  38.34 
 
 		 322 aa  226  7e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  33.09 
 
 		 391 aa  223  8e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  38.62 
 
 		 321 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  33.83 
 
 		 395 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  32.26 
 
 		 406 aa  200  5e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  31.52 
 
 		 411 aa  193  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  30.22 
 
 		 421 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  35.37 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  29.71 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 398 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  29.35 
 
 		 432 aa  174  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.34 
 
 		 342 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  30.31 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  29.26 
 
 		 438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  28.88 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  28.93 
 
 		 433 aa  160  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.09 
 
 		 540 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  28.25 
 
 		 433 aa  156  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  30.29 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  31.69 
 
 		 532 aa  146  8.000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  25.81 
 
 		 517 aa  144  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  43.97 
 
 		 316 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  27.34 
 
 		 434 aa  96.7  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  30.25 
 
 		 140 aa  81.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  31.25 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  29.13 
 
 		 148 aa  71.6  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  23.08 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  23.26 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25490  protein of unknown function (DUF1858)  33.87 
 
 		 344 aa  52  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0976  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.64 
 
 		 1079 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 617 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  24 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3309  hypothetical protein  34.29 
 
 		 178 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1806  oxidoreductase, putative, truncated  21.97 
 
 		 241 aa  44.3  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>