49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1059 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 536 aa  1092    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  65.49 
 
 		 521 aa  671    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  46.37 
 
 		 491 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  41.65 
 
 		 411 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  40.34 
 
 		 406 aa  324  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  40.1 
 
 		 395 aa  316  7e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  40.58 
 
 		 407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  43.45 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  41.83 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  41.06 
 
 		 415 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  36.23 
 
 		 410 aa  279  9e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  32.25 
 
 		 532 aa  265  2e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  34.45 
 
 		 432 aa  263  6e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.86 
 
 		 342 aa  262  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  31.6 
 
 		 517 aa  261  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  34.54 
 
 		 433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  36.12 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.39 
 
 		 398 aa  250  5e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  33.8 
 
 		 438 aa  250  6e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  34.65 
 
 		 517 aa  248  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  34.09 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  34.3 
 
 		 485 aa  244  3.9999999999999997e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  34.7 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  38.81 
 
 		 321 aa  243  7e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  38.58 
 
 		 322 aa  239  6.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  43.57 
 
 		 316 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  22.58 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  36.07 
 
 		 140 aa  92.8  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  24.81 
 
 		 270 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  24.05 
 
 		 270 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 		 416 aa  87.4  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  83.2  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1365  Domain of unknown function DUF1858  19.13 
 
 		 295 aa  72  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.75 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 617 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0976  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.88 
 
 		 1079 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0339  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  29.17 
 
 		 459 aa  53.5  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360791  unclonable  4.1095600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3387  hypothetical protein  32.56 
 
 		 178 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 615 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0923  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 621 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3190  hypothetical protein  32.56 
 
 		 178 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2152  hypothetical protein  34.88 
 
 		 276 aa  50.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0359  sensory box protein/sigma-54 dependent transcriptional regulator  27.59 
 
 		 458 aa  50.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3309  hypothetical protein  31.4 
 
 		 178 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  29.25 
 
 		 311 aa  48.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2930  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  22.94 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1537  hypothetical protein  37.93 
 
 		 258 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1295  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  22.94 
 
 		 457 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62254e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1659  flavoprotein  26.76 
 
 		 227 aa  44.3  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>