33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0166 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  61.15 
 
 
140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.33 
 
 
398 aa  87  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.23 
 
 
521 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 
536 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  31.5 
 
 
411 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  30.89 
 
 
406 aa  80.9  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  32.56 
 
 
432 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  33.06 
 
 
395 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  29.37 
 
 
415 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  32.23 
 
 
321 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  28.57 
 
 
421 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  32.26 
 
 
391 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.37 
 
 
342 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  27.35 
 
 
532 aa  75.1  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  30.23 
 
 
433 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  29.46 
 
 
433 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.91 
 
 
540 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  32.2 
 
 
416 aa  72  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  29.13 
 
 
517 aa  71.6  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.82 
 
 
316 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  27.56 
 
 
517 aa  70.1  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  25.58 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  27.56 
 
 
410 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  29.75 
 
 
491 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  28.23 
 
 
485 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  26.87 
 
 
398 aa  64.3  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  25.86 
 
 
434 aa  60.5  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  28.91 
 
 
438 aa  60.5  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  25.2 
 
 
407 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  27.35 
 
 
463 aa  52.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1659  flavoprotein  24.03 
 
 
227 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241633  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  26.24 
 
 
411 aa  45.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>